RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261497.8

USP22-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP22, Length 5,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22-201ENST00000261497 ACTR1AP61163 376 aa13.72□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 MBLAC2Q68D91 279 aa13.72□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 PYROXD2Q8N2H3 581 aa13.72□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 ZNF276Q8N554 614 aa13.72□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 MINDY3Q9H8M7 445 aa13.72□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 GALNT8Q9NY28 637 aa13.72□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 RCCD1A6NED2 376 aa13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 STAT5AP42229 794 aa13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 GALK1P51570 392 aa13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 DENND5AQ6IQ26 1287 aa13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 ZBTB2Q8N680 514 aa13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 ZNF248Q8NDW4 579 aa13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 S100ZQ8WXG8 99 aa13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 HPS1Q92902 700 aa13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 PPP1R14BQ96C90 147 aa13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 LMAN2LQ9H0V9 348 aa13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 CDH19Q9H159 772 aa13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 EPB41L4BQ9H329 900 aa13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 C3orf14Q9HBI5 128 aa13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 SNX15Q9NRS6 342 aa13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 DNAJC11Q9NVH1 559 aa13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 PACSIN3Q9UKS6 424 aa13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 ANGPT4Q9Y264 503 aa13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 CLDN4O14493 209 aa13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 ECT2LQ008S8 904 aa13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 AMZ1Q400G9 498 aa13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 MON1BQ7L1V2 547 aa13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 TCAIMQ8N3R3 496 aa13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 SGK2Q9HBY8 427 aa13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 IQCF5A8MTL0 148 aa13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 CSKP41240 450 aa13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 GRIA3P42263 894 aa13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 MTHFRP42898 656 aa13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 IDH2P48735 452 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 UBXN11Q5T124 520 aa13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 PPCDCQ96CD2 204 aa13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 FAXDC2Q96IV6 333 aa13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 REEP1Q9H902 201 aa13.71□□□□□ -0.21
USP22-201ENST00000261497 SDK1Q7Z5N4 2213 aa13.71□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 AZIN1O14977 448 aa13.71□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 FCHO2Q0JRZ9 810 aa13.71□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 SEMA5AQ13591 1074 aa13.71□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 C9orf64Q5T6V5 341 aa13.71□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 TMEM164Q5U3C3 297 aa13.71□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 ADHFE1Q8IWW8 467 aa13.71□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 SPATA22Q8NHS9 363 aa13.71□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 ZNF461Q8TAF7 563 aa13.71□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 ZNF671Q8TAW3 534 aa13.71□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 BORCS5Q969J3 196 aa13.71□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 MCMBPQ9BTE3 642 aa13.71□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 ACSS3Q9H6R3 686 aa13.71□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 NR2E1Q9Y466 385 aa13.71□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 CPED1A4D0V7 1026 aa13.7□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 LRATO95237 230 aa13.7□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 SHBGP04278 402 aa13.7□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 CCR3P51677 355 aa13.7□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 MTAPQ13126 283 aa13.7□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 LRRC73Q5JTD7 316 aa13.7□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 TMEM220Q6QAJ8 160 aa13.7□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 PACS1Q6VY07 963 aa13.7□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 PANX1Q96RD7 426 aa13.7□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 ATG10Q9H0Y0 220 aa13.7□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 PNPLA3Q9NST1 481 aa13.7□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 CMTM6Q9NX76 183 aa13.7□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 FBXW11Q9UKB1 542 aa13.7□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 WNT6Q9Y6F9 365 aa13.7□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 FFAR2O15552 330 aa13.7□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 JAG1P78504 1218 aa13.7□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 FOLH1Q04609 750 aa13.7□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 CMC1Q7Z7K0 106 aa13.7□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP13.7□□□□□ -0.225e-6■■■■■ 29.2
USP22-201ENST00000261497 PRSS58Q8IYP2 241 aa13.7□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 BADQ92934 168 aa13.7□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa13.7□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa13.7□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 C9IYK1 514 aa13.7□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 IRAK2O43187 625 aa13.7□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 RPIAP49247 311 aa13.7□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 USP46P62068 366 aa13.7□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 ZNF846Q147U1 533 aa13.7□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 CLEC20AQ6ZU45 233 aa13.7□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 HIPK1Q86Z02 1210 aa13.7□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 KBTBD8Q8NFY9 601 aa13.7□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 SAMD11Q96NU1 681 aa13.7□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms