RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 C10orf88Q9H8K7 445 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 SIRPGQ9P1W8 387 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 DKK3Q9UBP4 350 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 UNC13CQ8NB66 2214 aa24.08■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 INSIG1O15503 277 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 HSD17B3P37058 310 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 NDST2P52849 883 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 PMS2P54278 862 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 TCEA2Q15560 299 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 LVRNQ6Q4G3 990 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB11FIP2Q7L804 512 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 PRUNE1Q86TP1 453 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXO39Q8N4B4 442 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 CPT1BQ92523 772 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 SPATA13Q96N96 652 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 MED4Q9NPJ6 270 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 GULP1Q9UBP9 304 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 TRHDEQ9UKU6 1024 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 COQ6Q9Y2Z9 468 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 GOLGA6BA6NDN3 693 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 RAMP2O60895 175 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 ITGB6P18564 788 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 CCNCP24863 283 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 CCKBRP32239 447 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 FDFT1P37268 417 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 GARSP41250 739 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 CDK16Q00536 496 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 HID1Q8IV36 788 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 CXorf40AQ8TE69 158 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 NUDT17P0C025 328 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 ELOCQ15369 112 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 SFTPA2Q8IWL1 248 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 NPWQ8N729 165 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 MCUQ8NE86 351 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR156Q8NFN8 814 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 LHX3Q9UBR4 397 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 TSPAN11A1L157 253 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 WT1P19544 449 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 INHBCP55103 352 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 NFATC3Q12968 1075 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 NFATC4Q14934 902 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 PARP6Q2NL67 630 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 CCNYQ8ND76 341 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRN3Q9H3W5 708 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 STARD5Q9NSY2 213 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR34Q9UPC5 381 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 RELNP78509 3460 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 TERTO14746 1132 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 BLKP51451 505 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 WASHC5Q12768 1159 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 SEMA5AQ13591 1074 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNJ11Q14654 390 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC14Q15048 493 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 CROCCP2Q86T23 111 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 ZSWIM9Q86XI8 627 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 SGF29Q96ES7 293 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 APOOQ9BUR5 198 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 OR1A2Q9Y585 309 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 FLNCQ14315 2725 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 E7ESA3 106 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 AGPSO00116 658 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 NVLO15381 856 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 RASGRP1O95267 797 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 PIGNO95427 931 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 ALPIP09923 528 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 TPSB2P20231 275 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 ETV5P41161 510 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 CSRP3P50461 194 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 SRP54P61011 504 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 AP1B1Q10567 949 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 INPP5AQ14642 412 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 AGERQ15109 404 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-216ENST00000628306 CYTH1Q15438 398 aa24.03■■□□□ 1.44
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