RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	TBATA	Q96M53	351 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	PSKH2	Q96QS6	385 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	TAAR9	Q96RI9	348 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	KCND3	Q9UK17	655 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	CENPE	Q02224	2701 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	TMEM202	A6NGA9	273 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	HACD1	B0YJ81	288 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	VPS4B	O75351	444 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	RASGRP1	O95267	797 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	PCCB	P05166	539 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	ALPI	P09923	528 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	CD82	P27701	267 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	CXCR5	P32302	372 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	RENBP	P51606	427 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	RHOA	P61586	193 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	XRCC4	Q13426	336 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	ARHGEF7	Q14155	803 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	INPP5A	Q14642	412 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	MARC1	Q5VT66	337 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	TTC7B	Q86TV6	843 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	GKN2	Q86XP6	184 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	TEX19	Q8NA77	164 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	TTC13	Q8NBP0	860 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	KL	Q9UEF7	1012 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	SNX12	Q9UMY4	172 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	VPS4A	Q9UN37	437 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	KCNK1	O00180	336 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	CEP104	O60308	925 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	DNAJB5	O75953	348 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	TM7SF2	O76062	418 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	CCNB1	P14635	433 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	CD1C	P29017	333 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	CSF2RB	P32927	897 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	MMP13	P45452	471 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	YPEL5	P62699	121 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	AP1B1	Q10567	949 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	MYLK3	Q32MK0	819 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	PIM3	Q86V86	326 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	ASB12	Q8WXK4	309 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	TMEM159	Q96B96	161 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	PBK	Q96KB5	322 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	APOO	Q9BUR5	198 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	FGF22	Q9HCT0	170 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	APMAP	Q9HDC9	416 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	LUZP4	Q9P127	313 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	MED13	Q9UHV7	2174 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	TTLL8	A6PVC2	850 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	EFCAB7	A8K855	629 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	CES2	O00748	559 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	FANCG	O15287	622 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	INSIG1	O15503	277 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	IGSF6	O95976	241 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	JCHAIN	P01591	159 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	PRF1	P14222	555 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	TIMP2	P16035	220 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	RGR	P47804	291 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	CSNK1D	P48730	415 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	ZNF235	Q14590	738 aa		13.74	□□□□□ -0.21

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