RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 SUPT3HB4E1H0 165 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 SUPT3HO75486 399 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 EPHA3P29320 983 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 SPAM1P38567 509 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ETV3P41162 512 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 PTGER3P43115 390 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 KCNJ2P63252 427 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 PFKPQ01813 784 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 CDKN3Q16667 212 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 SH2D4BQ5SQS7 431 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 FBXW10Q5XX13 1052 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 NXNQ6DKJ4 435 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 GRAMD4Q6IC98 578 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ANKRD54Q6NXT1 300 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 MAVSQ7Z434 540 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 SNX20Q7Z614 316 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 GALNT7Q86SF2 657 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 CNPY4Q8N129 248 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 GIMAP7Q8NHV1 300 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 MAPK15Q8TD08 544 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ECHDC3Q96DC8 303 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 CHFRQ96EP1 664 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 LINGO1Q96FE5 620 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 SYTL2Q9HCH5 934 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 PCDH12Q9NPG4 1184 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 IKZF3Q9UKT9 509 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 RNF112Q9ULX5 631 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 SLC12A4Q9UP95 1085 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ANKRD12Q6UB98 2062 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 H7C0S8 307 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 PPP6CO00743 305 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 JUNP05412 331 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ENO1P06733 434 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 AKT1P31749 480 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 IL2P60568 153 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 NCALDP61601 193 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 RUNX3Q13761 415 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 GALNTL6Q49A17 601 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 RDH11Q8TC12 318 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 TTC1Q99614 292 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 DRC3Q9H069 523 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 LMAN2LQ9H0V9 348 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ZNF576Q9H609 170 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 DZANK1Q9NVP4 752 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ANKRD36A6QL64 1941 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 DENND4CQ5VZ89 1909 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 COL6A3P12111 3177 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 C16orf96A6NNT2 1141 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 UNC5CO95185 931 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ESR1P03372 595 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 EPHX1P07099 455 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 FCARP24071 287 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 GJA4P35212 333 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 IDH3AP50213 366 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 BRAT1Q6PJG6 821 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 LCA5Q86VQ0 697 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 TDHQ8IZJ6 230 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 RBFAQ8N0V3 343 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 CD200R1Q8TD46 325 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 LATS2Q9NRM7 1088 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ARL8BQ9NVJ2 186 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 FBXO10Q9UK96 956 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 GON4LQ3T8J9 2241 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 LOC100653049A0A140TA62 436 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 H3BQ06 376 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 SMIM24O75264 130 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 TBX10O75333 385 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 KRT34O76011 436 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 GUCA1CO95843 209 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 TPBGLP0DKB5 382 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 T-ENOLP0DO92 83 aa8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58 ms