RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 GOLGA8MH3BSY2 632 aa11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 SPINT1O43278 529 aa11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 CTIFO43310 598 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 FZD6O60353 706 aa11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM63AO94886 807 aa11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 CPP00450 1065 aa11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 PRLP01236 227 aa11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 PDHA1P08559 390 aa11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 CXADRP78310 365 aa11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 TLE3Q04726 772 aa11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 C19orf57Q0VDD7 668 aa11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 HIF1AQ16665 826 aa11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 SIRPB2Q5JXA9 342 aa11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 ARMC3Q5W041 872 aa11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 GUSBP11Q6P575 273 aa11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 CENPUQ71F23 418 aa11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 TTC7BQ86TV6 843 aa11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 RBFAQ8N0V3 343 aa11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF248Q8NDW4 579 aa11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 LPCAT1Q8NF37 534 aa11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 LRRC39Q96DD0 335 aa11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 NSMCE3Q96MG7 304 aa11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 SERPINB12Q96P63 405 aa11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 TRIB3Q96RU7 358 aa11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 FMO2Q99518 471 aa11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 APOL2Q9BQE5 337 aa11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 HACD3Q9P035 362 aa11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 KLF15Q9UIH9 416 aa11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 NFU1Q9UMS0 254 aa11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 NBEAQ8NFP9 2946 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 TSPAN11A1L157 253 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 MAGEB16A2A368 324 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 TP73O15350 636 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 MMP20O60882 483 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 GRIA1P42261 906 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 PFN3P60673 137 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 CBLBQ13191 982 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 C1orf61Q13536 156 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 GALNT3Q14435 633 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 QPCTQ16769 361 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 UGP2Q16851 508 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 MAP9Q49MG5 647 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 PRRT3Q5FWE3 981 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 C3orf38Q5JPI3 329 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 DENND5AQ6IQ26 1287 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 ERAP2Q6P179 960 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 CRTC1Q6UUV9 634 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 ZDHHC24Q6UX98 284 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 USP45Q70EL2 814 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 CCNJLQ8IV13 435 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 LSMEM2Q8N112 164 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 DENND6BQ8NEG7 585 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 CXorf40AQ8TE69 158 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 BTN2A2Q8WVV5 523 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 PIH1D2Q8WWB5 315 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 ASB12Q8WXK4 309 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 SCRN2Q96FV2 425 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 PHACTR1Q9C0D0 580 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 IL22Q9GZX6 179 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 TRABDQ9H4I3 376 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 MAGEE1Q9HCI5 957 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 SAMD15Q9P1V8 674 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 SPASTQ9UBP0 616 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 RAB21Q9UL25 225 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 PPIL1Q9Y3C6 166 aa11.29□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 IGSF10Q6WRI0 2623 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 A0A0J9YYE9 177 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 TK2O00142 265 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 TPP1O14773 563 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 AREL1O15033 823 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 ERLIN1O75477 346 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 TM7SF2O76062 418 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 CRTAMO95727 393 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 TRBC1P01850 177 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 TIMP2P16035 220 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 TPH1P17752 444 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 ADRA1DP25100 572 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 IGFALSP35858 605 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 CHRNA4P43681 627 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 LSSP48449 732 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 VSNL1P62760 191 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 PDE1BQ01064 536 aa11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms