RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
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SH3BP2-221ENST00000511747 PRAMEF11O60813 436 aa26.89■■□□□ 1.9
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SH3BP2-221ENST00000511747 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
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SH3BP2-221ENST00000511747 LZICQ8WZA0 190 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP2-221ENST00000511747 C1orf50Q9BV19 199 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP2-221ENST00000511747 SPO11Q9Y5K1 396 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP2-221ENST00000511747 KANSL1LA0AUZ9 987 aa26.85■■□□□ 1.89
SH3BP2-221ENST00000511747 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
SH3BP2-221ENST00000511747 IQCA1LA6NCM1 817 aa26.85■■□□□ 1.89
SH3BP2-221ENST00000511747 SNX2O60749 519 aa26.85■■□□□ 1.89
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