RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 S1PR4O95977 384 aa21.1■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 CD4P01730 458 aa21.1■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 MTHFD2P13995 350 aa21.1■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 LBPP18428 481 aa21.1■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 RCVRNP35243 200 aa21.1■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 GEMP55040 296 aa21.1■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 USP51Q70EK9 711 aa21.1■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 C3orf58Q8NDZ4 430 aa21.1■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCDC126Q96EE4 140 aa21.1■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa21.1■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 TOR3AQ9H497 397 aa21.1■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRDM8Q9NQV8 689 aa21.1■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZBBXA8MT70 800 aa21.09■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 SUPT3HB4E1H0 165 aa21.09■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 HTR1BP28222 390 aa21.09■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 HCAR3P49019 387 aa21.09■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 BNIP2Q12982 314 aa21.09■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC22A9Q8IVM8 553 aa21.09■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 FBXO30Q8TB52 745 aa21.09■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZFP90Q8TF47 636 aa21.09■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 STON2Q8WXE9 905 aa21.09■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 HPS1Q92902 700 aa21.09■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 SMIM14Q96QK8 99 aa21.09■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 RAD21L1Q9H4I0 556 aa21.09■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 ASB1Q9Y576 335 aa21.09■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 ARL5AQ9Y689 179 aa21.09■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 TSC2P49815 1807 aa21.09■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 PTGESO14684 152 aa21.09■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 CD1DP15813 335 aa21.09■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 NFKBIAP25963 317 aa21.09■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 TGFBR1P36897 503 aa21.09■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP21.09■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC10A7Q0GE19 358 aa21.09■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 DPY19L1Q2PZI1 675 aa21.09■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 NIPAL1Q6NVV3 410 aa21.09■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 CRTC3Q6UUV7 619 aa21.09■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRR23BQ6ZRT6 265 aa21.09■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 LPPQ93052 612 aa21.09■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 IL12RB2Q99665 862 aa21.09■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 PSME2Q9UL46 239 aa21.09■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 LOC285556D6RIA3 1793 aa21.09■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 SOBPA7XYQ1 873 aa21.08■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 ALDH2P05091 517 aa21.08■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 GGT5P36269 586 aa21.08■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 CLCN5P51795 746 aa21.08■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 DGKQP52824 942 aa21.08■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 KCNK10P57789 538 aa21.08■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 PM20D1Q6GTS8 502 aa21.08■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 OR2T11Q8NH01 316 aa21.08■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 CD320Q9NPF0 282 aa21.08■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 IPPQ9Y573 584 aa21.08■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 U3KQV3 271 aa21.08■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 MATN3O15232 486 aa21.08■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 CACNG3O60359 315 aa21.08■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 TSPAN3O60637 253 aa21.08■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 SEC14L2O76054 403 aa21.08■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 WARSP23381 471 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 JAK1P23458 1154 aa21.08■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCNCP24863 283 aa21.08■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 ARSFP54793 590 aa21.08■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 LAPTM4AQ15012 233 aa21.08■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMEM236Q5W0B7 351 aa21.08■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 GLYATQ6IB77 296 aa21.08■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 SPARTQ8N0X7 666 aa21.08■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 CADM3Q8N126 398 aa21.08■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 SFRP1Q8N474 314 aa21.08■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 OR13C4Q8NGS5 318 aa21.08■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa21.08■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMEM209Q96SK2 561 aa21.08■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa21.08■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa21.08■□□□□ 0.97
CSNK1G2-201ENST00000255641 UPK1AO00322 258 aa21.08■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 HPCAL1P37235 193 aa21.08■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 GPR142Q7Z601 462 aa21.08■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 ALPK1Q96QP1 1244 aa21.08■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 CORO1BQ9BR76 489 aa21.08■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 GNPTGQ9UJJ9 305 aa21.08■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 WDR37Q9Y2I8 494 aa21.08■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa21.08■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 GPR45Q9Y5Y3 372 aa21.08■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 CPQQ9Y646 472 aa21.08■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
CSNK1G2-201ENST00000255641 IQCA1LA6NCM1 817 aa21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms