RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527397.1

RAB1B-202, Transcript of RAB1B, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RAB1B, Length 991 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1B-202ENST00000527397 OR6P1Q8NGX9 317 aa16■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 OR2W6PQ8NHA6 318 aa16■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 ZNF398Q8TD17 642 aa16■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 SLC44A1Q8WWI5 657 aa16■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 KLK6Q92876 244 aa16■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 AP2M1Q96CW1 435 aa16■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 VPS35Q96QK1 796 aa16■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 GPR174Q9BXC1 333 aa16■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 PCED1AQ9H1Q7 454 aa16■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 FAM96AQ9H5X1 160 aa16■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 CATSPERZQ9NTU4 200 aa16■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 HMX2A2RU54 273 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 FAM86C2PA6NEL3 165 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 METTL12A8MUP2 240 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 AHSGP02765 367 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 F7P08709 466 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 SLC1A2P43004 574 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 NAB1Q13506 487 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 STAT4Q14765 748 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 GPR33Q49SQ1 333 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 PNCKQ6P2M8 343 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 LONP2Q86WA8 852 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 SLC26A11Q86WA9 606 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 TMEM145Q8NBT3 493 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 CADM4Q8NFZ8 388 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 DCAKDQ8WVC6 231 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 BIRC7Q96CA5 298 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 COX14Q96I36 57 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 ZIM3Q96PE6 472 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 CYTH2Q99418 400 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 ASB8Q9H765 288 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 FBXO5Q9UKT4 447 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 PLAAQ9Y263 795 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 INVSQ9Y283 1065 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 USP34Q70CQ2 3546 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 SPAG17Q6Q759 2223 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 PRR23AA6NEV1 266 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 FAM47DPA6NHR8 397 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 AGPSO00116 658 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 FAM155BO75949 473 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 IGFALSP35858 605 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 MPP1Q00013 466 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 B4GALNT1Q00973 533 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 CTBP1Q13363 440 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 RASA2Q15283 850 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 IRF4Q15306 451 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 DBN1Q16643 649 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 ZNF528Q3MIS6 628 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 ZNF470Q6ECI4 717 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 KDM7AQ6ZMT4 941 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 KIAA0408Q6ZU52 694 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 TDRPQ86YL5 185 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 NXPE1Q8N323 547 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 DENND6BQ8NEG7 585 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 C1orf216Q8TAB5 229 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 BTN2A2Q8WVV5 523 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 BMFQ96LC9 184 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 FAM167BQ9BTA0 163 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 TEX101Q9BY14 249 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 PRR33A8MZF0 331 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 SGTAO43765 313 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 HAUS5O94927 633 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 ACRV1P26436 265 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 CSRP3P50461 194 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 ZNF844Q08AG5 666 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 ITGA9Q13797 1035 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 LRRC14Q15048 493 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 ADGRD1Q6QNK2 874 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 LRIG3Q6UXM1 1119 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 PACS1Q6VY07 963 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 SERPINA9Q86WD7 417 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 LRRC6Q86X45 466 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 ZBTB44Q8NCP5 570 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 DDHD1Q8NEL9 900 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 CALML6Q8TD86 181 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 LPGAT1Q92604 370 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 TCF12Q99081 682 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 PAFAH2Q99487 392 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 SPATA16Q9BXB7 569 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 P2RY12Q9H244 342 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 VIPAS39Q9H9C1 493 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 FZD3Q9NPG1 666 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB1B-202ENST00000527397 GPR27Q9NS67 375 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms