RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488684.5

POLR2F-211, Transcript of RNA polymerase II subunit F, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR2F, Length 564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2F-211ENST00000488684 ART4Q93070 314 aa22.22■■□□□ 1.15
POLR2F-211ENST00000488684 NKD1Q969G9 470 aa22.22■■□□□ 1.15
POLR2F-211ENST00000488684 IQCDQ96DY2 449 aa22.22■■□□□ 1.15
POLR2F-211ENST00000488684 OCIAD1Q9NX40 245 aa22.22■■□□□ 1.15
POLR2F-211ENST00000488684 DTLQ9NZJ0 730 aa22.22■■□□□ 1.15
POLR2F-211ENST00000488684 DNPEPQ9ULA0 475 aa22.22■■□□□ 1.15
POLR2F-211ENST00000488684 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
POLR2F-211ENST00000488684 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa22.22■■□□□ 1.15
POLR2F-211ENST00000488684 FADS2P1A8MWK0 482 aa22.21■■□□□ 1.15
POLR2F-211ENST00000488684 STMND1H3BQB6 276 aa22.21■■□□□ 1.15
POLR2F-211ENST00000488684 SLC28A2O43868 658 aa22.21■■□□□ 1.15
POLR2F-211ENST00000488684 JCHAINP01591 159 aa22.21■■□□□ 1.15
POLR2F-211ENST00000488684 FAM87AP0C7U9 286 aa22.21■■□□□ 1.15
POLR2F-211ENST00000488684 ITGB6P18564 788 aa22.21■■□□□ 1.15
POLR2F-211ENST00000488684 SPINT3P49223 89 aa22.21■■□□□ 1.15
POLR2F-211ENST00000488684 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
POLR2F-211ENST00000488684 XKR5Q6UX68 686 aa22.21■■□□□ 1.15
POLR2F-211ENST00000488684 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
POLR2F-211ENST00000488684 MAP7D3Q8IWC1 876 aa22.21■■□□□ 1.15
POLR2F-211ENST00000488684 CNTD1Q8N815 330 aa22.21■■□□□ 1.15
POLR2F-211ENST00000488684 RAPGEF5Q92565 580 aa22.21■■□□□ 1.15
POLR2F-211ENST00000488684 HDAC11Q96DB2 347 aa22.21■■□□□ 1.15
POLR2F-211ENST00000488684 DPYSL5Q9BPU6 564 aa22.21■■□□□ 1.15
POLR2F-211ENST00000488684 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa22.21■■□□□ 1.15
POLR2F-211ENST00000488684 IFNKQ9P0W0 207 aa22.21■■□□□ 1.15
POLR2F-211ENST00000488684 VPS18Q9P253 973 aa22.21■■□□□ 1.15
POLR2F-211ENST00000488684 PDP2Q9P2J9 529 aa22.21■■□□□ 1.15
POLR2F-211ENST00000488684 UVRAGQ9P2Y5 699 aa22.21■■□□□ 1.15
POLR2F-211ENST00000488684 TBC1D29Q9UFV1 150 aa22.21■■□□□ 1.15
POLR2F-211ENST00000488684 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa22.2■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 ANKRD66B4E2M5 251 aa22.2■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 KCNK1O00180 336 aa22.2■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 KRT7P08729 469 aa22.2■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 MX2P20592 715 aa22.2■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 CA4P22748 312 aa22.2■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 KDELR1P24390 212 aa22.2■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 CD86P42081 329 aa22.2■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 GPLD1P80108 840 aa22.2■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 CCDC13Q8IYE1 715 aa22.2■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa22.2■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 CCNYQ8ND76 341 aa22.2■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 EID2BQ96D98 161 aa22.2■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 RNF157Q96PX1 679 aa22.2■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 SLC38A3Q99624 504 aa22.2■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 FAM83DQ9H4H8 585 aa22.2■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 H2AFZP0C0S5 128 aa22.19■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 UGT1A3P35503 534 aa22.19■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 ZBTB17Q13105 803 aa22.19■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 IYDQ6PHW0 289 aa22.19■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 H2AFVQ71UI9 128 aa22.19■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 DDA1Q9BW61 102 aa22.19■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 SLC12A9Q9BXP2 914 aa22.19■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 STARD5Q9NSY2 213 aa22.19■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 HAUS2Q9NVX0 235 aa22.19■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 SLC39A1Q9NY26 324 aa22.19■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 KCNK6Q9Y257 313 aa22.19■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 HECTD1Q9ULT8 2610 aa22.19■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 A6NCN8 305 aa22.18■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 EFCAB7A8K855 629 aa22.18■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 HHEXQ03014 270 aa22.18■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 PLD5Q8N7P1 536 aa22.18■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 BMPERQ8N8U9 685 aa22.18■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 OR10G6Q8NH81 332 aa22.18■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 PKD2L2Q9NZM6 624 aa22.18■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 A8MU76 341 aa22.17■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 B4E171 279 aa22.17■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 ACP5P13686 325 aa22.17■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 TSPAN7P41732 249 aa22.17■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 NFKB2Q00653 900 aa22.17■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 NFATC2Q13469 925 aa22.17■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 CLCA4Q14CN2 919 aa22.17■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 SLC18A3Q16572 532 aa22.17■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 SNAP47Q5SQN1 464 aa22.17■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa22.17■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 ANKS6Q68DC2 871 aa22.17■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa22.17■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa22.17■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa22.17■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 FAM129CQ86XR2 697 aa22.17■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 CCDC112Q8NEF3 446 aa22.17■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 ARFGAP3Q9NP61 516 aa22.17■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 RGSL1A5PLK6 1076 aa22.16■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa22.16■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 DUX1O43812 170 aa22.16■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 LIFP15018 202 aa22.16■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 MAN1A1P33908 653 aa22.16■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 ATP1A2P50993 1020 aa22.16■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 GALNT3Q14435 633 aa22.16■■□□□ 1.14
POLR2F-211ENST00000488684 MESDQ14696 234 aa22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms