RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229265.10

CDCA3-201, Transcript of cell division cycle associated 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDCA3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3-201ENST00000229265 NFKB2Q00653 900 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 PFKPQ01813 784 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 SATB1Q01826 763 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 BCL2L1Q07817 233 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 OVGP1Q12889 678 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 ITGA9Q13797 1035 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 GPR33Q49SQ1 333 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 ARMC12Q5T9G4 340 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 CNSTQ6PJW8 725 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 EPGNQ6UW88 154 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 MTSS1LQ765P7 747 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 KDELC2Q7Z4H8 507 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 MFSD6LQ8IWD5 586 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 CMTM8Q8IZV2 173 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 OR52K2Q8NGK3 314 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP10.63□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 NXNL1Q96CM4 212 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 CMTM5Q96DZ9 223 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 SORT1Q99523 831 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 MECRQ9BV79 373 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 CDH19Q9H159 772 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 TDP1Q9NUW8 608 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 TAS2R13Q9NYV9 303 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 KLHL42Q9P2K6 505 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 GGT7Q9UJ14 662 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 HS3ST2Q9Y278 367 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 PKP3Q9Y446 797 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 CAPN14A8MX76 684 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 ANKRD65E5RJM6 399 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 MATN2O00339 956 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF195O14628 629 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 STX7O15400 261 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 NDUFS3O75489 264 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 WFS1O76024 890 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 IPO13O94829 963 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 POP4O95707 220 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 HSPA4LO95757 839 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 IGSF6O95976 241 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 GOT2P00505 430 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 LMNAP02545 664 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 FGF4P08620 206 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 PSMC3P17980 439 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 TFEBP19484 476 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 FDXRP22570 491 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 SERPINB3P29508 390 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 SLC8A1P32418 973 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 RCN2Q14257 317 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 WASHC2DQ5SRD0 308 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 CYB5D1Q6P9G0 228 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 C1orf210Q8IVY1 113 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 PARP9Q8IXQ6 854 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 GPATCH11Q8N954 259 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 SUMF1Q8NBK3 374 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 STAG3L4Q8TBR4 150 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 NELL1Q92832 810 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 LRIG1Q96JA1 1093 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 SCYL1Q96KG9 808 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 LMLNQ96KR4 655 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 RILPQ96NA2 401 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 FAM83CQ9BQN1 747 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 CCDC106Q9BWC9 280 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 C20orf27Q9GZN8 174 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 CCDC68Q9H2F9 335 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 EBF3Q9H4W6 596 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 BRD9Q9H8M2 597 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 CAB39LQ9H9S4 337 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 PFDN4Q9NQP4 134 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 LATS2Q9NRM7 1088 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 MARK1Q9P0L2 795 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 IL17CQ9P0M4 197 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 CFAP97Q9P2B7 532 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 SLC17A6Q9P2U8 582 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 LHX3Q9UBR4 397 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 TAGLN3Q9UI15 199 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 VPS51Q9UID3 782 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 WNT6Q9Y6F9 365 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 PIAS3Q9Y6X2 628 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 DOCK4Q8N1I0 1966 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 CCDC162PA2VCL2 907 aa10.61□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 SYCE1LA8MT33 242 aa10.61□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 GOLGA8TH3BQL2 631 aa10.61□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 K7ESF4 209 aa10.61□□□□□ -0.71
CDCA3-201ENST00000229265 FCHO1O14526 889 aa10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms