RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216484.6

SPTLC2-201, Transcript of serine palmitoyltransferase long chain base subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPTLC2, Length 8,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC2-201ENST00000216484 CELF2O95319 508 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
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SPTLC2-201ENST00000216484 SLC39A12Q504Y0 691 aa14.56□□□□□ -0.08
SPTLC2-201ENST00000216484 FUKQ8N0W3 1084 aa14.56□□□□□ -0.08
SPTLC2-201ENST00000216484 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SPTLC2-201ENST00000216484 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa14.56□□□□□ -0.08
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SPTLC2-201ENST00000216484 TMEM39BQ9GZU3 492 aa14.56□□□□□ -0.08
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SPTLC2-201ENST00000216484 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
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SPTLC2-201ENST00000216484 TMEM27Q9HBJ8 222 aa14.55□□□□□ -0.08
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SPTLC2-201ENST00000216484 ASF1AQ9Y294 204 aa14.55□□□□□ -0.08
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SPTLC2-201ENST00000216484 FAM153CQ494X1 144 aa14.55□□□□□ -0.08
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SPTLC2-201ENST00000216484 BLMHQ13867 455 aa14.54□□□□□ -0.08
SPTLC2-201ENST00000216484 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SPTLC2-201ENST00000216484 TM6SF2Q9BZW4 377 aa14.54□□□□□ -0.08
SPTLC2-201ENST00000216484 MARCH2Q9P0N8 246 aa14.54□□□□□ -0.08
SPTLC2-201ENST00000216484 PTPRKQ15262 1439 aa14.54□□□□□ -0.08
SPTLC2-201ENST00000216484 CCNB1P14635 433 aa14.54□□□□□ -0.08
SPTLC2-201ENST00000216484 PEX6Q13608 980 aa14.54□□□□□ -0.08
SPTLC2-201ENST00000216484 DCST1Q5T197 706 aa14.54□□□□□ -0.08
SPTLC2-201ENST00000216484 PHC2Q8IXK0 858 aa14.54□□□□□ -0.08
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