RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366391.6

SH3BP5-201, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-201ENST00000366391 FAM118BQ9BPY3 351 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 FAM83DQ9H4H8 585 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 SIRPGQ9P1W8 387 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 GULP1Q9UBP9 304 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 SUFUQ9UMX1 484 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 CLCA2Q9UQC9 943 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 INPP4BO15327 924 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 KRT86O43790 486 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 CAPNS1P04632 268 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 IVLP07476 585 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 GNPDA1P46926 289 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 PERM1Q5SV97 790 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 DOK6Q6PKX4 331 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 TMC3Q7Z5M5 1100 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 TRIM74Q86UV6 250 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 LRRC8AQ8IWT6 810 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 ARL10Q8N8L6 244 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 KYQ8NBH2 561 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 CCL4L1Q8NHW4 92 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 MAPK15Q8TD08 544 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 NAT6Q93015 286 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 COX14Q96I36 57 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 MRGPRX2Q96LB1 330 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 FERMT1Q9BQL6 677 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 GPR63Q9BZJ6 419 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 RSPH14Q9UHP6 348 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 PADI4Q9UM07 663 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 GUCA1BQ9UMX6 200 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 SPO11Q9Y5K1 396 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 FADS2P1A8MWK0 482 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 MT-CO3P00414 261 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 EPOP01588 193 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 MPP3Q13368 585 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 CDCP2Q5VXM1 449 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 FAM46DQ8NEK8 389 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 GPBAR1Q8TDU6 330 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 ABCG4Q9H172 646 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 GBA3Q9H227 469 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 ADAMTS20P59510 1910 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 KCNN4O15554 427 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC4A1P02730 911 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 PTMAP06454 111 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 CHRNA4P43681 627 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 DCDC1P59894 354 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 SIRPB2Q5JXA9 342 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 OGFOD3Q6PK18 319 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 NRROSQ86YC3 692 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 TTC13Q8NBP0 860 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 GPR26Q8NDV2 337 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 GPR156Q8NFN8 814 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 IPMKQ8NFU5 416 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 MDM1Q8TC05 714 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 GSDMCQ9BYG8 508 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 AURKAO14965 403 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 NOBOXO60393 691 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 ANXA9O76027 345 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 STK10O94804 968 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 ASMTLO95671 621 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 ADCY8P40145 1251 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 GEMP55040 296 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 CCZ1BP86790 482 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 ALS2CLQ60I27 953 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 SFTPA2Q8IWL1 248 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC25A41Q8N5S1 370 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 GORASP1Q9BQQ3 440 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 SPATA16Q9BXB7 569 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 CDH19Q9H159 772 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 DPEP2Q9H4A9 486 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 RAD18Q9NS91 495 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 DKK4Q9UBT3 224 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 ST14Q9Y5Y6 855 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 ZZEF1O43149 2961 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 B4DGG1 531 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 CCDC175P0C221 793 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 BPIP17213 487 aa18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms