RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363377.1

RNU6-254P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 254, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-254P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-254P-201ENST00000363377 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-254P-201ENST00000363377 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-254P-201ENST00000363377 LDLRAD4O15165 306 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 SPINT2O43291 252 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 WDR1O75083 606 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 EGFP01133 1207 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 HOXB5P09067 269 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 CDAP32320 146 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 ABCD1P33897 745 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 AMPHP49418 695 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 GRIK2Q13002 908 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 FGFBP1Q14512 234 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 USP41Q3LFD5 358 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 TMEM35AQ53FP2 167 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 PQLC2Q6ZP29 291 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 CCDC13Q8IYE1 715 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 BEST3Q8N1M1 668 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 CADM4Q8NFZ8 388 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 HTRA1Q92743 480 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 PIGTQ969N2 578 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 RHBDF1Q96CC6 855 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 SAAL1Q96ER3 474 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 GRAMD2BQ96HH9 432 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 KIF9Q9HAQ2 790 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 SLC6A13Q9NSD5 602 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 FAM118AQ9NWS6 357 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 LUZP4Q9P127 313 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 HAO1Q9UJM8 370 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 SARDHQ9UL12 918 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 PTPRCP08575 1304 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 A0A1W2PQM1 296 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 VCYO14598 125 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 LDLRP01130 860 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 FGF5P12034 268 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 XBP1P17861 261 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 CD53P19397 219 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 SREBF2Q12772 1141 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 PTP4A2Q12974 167 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 C6orf141Q5SZD1 244 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 DCST1Q5T197 706 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 BSPRYQ5W0U4 402 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 ZNF280DQ6N043 979 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 FAM171BQ6P995 826 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 BRAT1Q6PJG6 821 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 GSTA5Q7RTV2 222 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 CPXCR1Q8N123 301 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 MYRIPQ8NFW9 859 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 ST8SIA4Q92187 359 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 APBB2Q92870 758 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 QRFPRQ96P65 431 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 TMEM47Q9BQJ4 181 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 SLC25A18Q9H1K4 315 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 BRF2Q9HAW0 419 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 ASAH2Q9NR71 780 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 CAMK2AQ9UQM7 478 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 NCAM2O15394 837 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 ZNHIT1O43257 154 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 ZG16O60844 167 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 F9P00740 461 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 APOHP02749 345 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 IL7RP16871 459 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 ABCD3P28288 659 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 MMP14P50281 582 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 TUBP50607 506 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 ATP12AP54707 1039 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 TAS2R38P59533 333 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 KRTAP10-8P60410 259 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 ZNF234Q14588 700 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 ALG11Q2TAA5 492 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 SIRPB2Q5JXA9 342 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 C18orf63Q68DL7 685 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 OR7E24Q6IFN5 339 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 GPR180Q86V85 440 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 MAP7D3Q8IWC1 876 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 OR5R1Q8NH85 324 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 OR14L1PQ8NHC6 308 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-254P-201ENST00000363377 NFKBIDQ8NI38 313 aa2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms