RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 IKQ13123 557 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 OASLQ15646 514 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF805Q5CZA5 627 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRIF1Q5T3J3 769 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 RGMBQ6NW40 437 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM122CQ6P4D5 195 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRBA2Q6ZNG9 492 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 CFAP77Q6ZQR2 320 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 CREB3L2Q70SY1 520 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLIP4Q8N3C7 705 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR2AK2Q8NG84 335 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR1J2Q8NGS2 313 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 NEUROG1Q92886 237 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 ORAI1Q96D31 301 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 LYZL4Q96KX0 146 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR2A14Q96R47 310 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 FIZ1Q96SL8 496 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 WACQ9BTA9 647 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 TM6SF1Q9BZW5 370 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 PIGMQ9H3S5 423 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 STK39Q9UEW8 545 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 FBXL17Q9UF56 701 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR14J1Q9UGF5 321 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM5Q9Y2B1 443 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 NFS1Q9Y697 457 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 M0QZ24 198 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAP2K7O14733 419 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 HS3ST1O14792 307 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPINT2O43291 252 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 AHCYL1O43865 530 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 RFPL2O75678 378 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 HIST1H2ABP04908 130 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 PORP16435 677 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 HIST1H2ADP20671 130 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 PON1P27169 355 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 GCH1P30793 250 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 FASLGP48023 281 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 THBS3P49746 956 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPR143P51810 404 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 MFAP4P55083 255 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 SREBF2Q12772 1141 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 EPS8Q12929 822 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 GRIK2Q13002 908 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRAF3Q13114 568 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYBPHQ13203 477 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 FHL1Q13642 323 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 TNFAIP1Q13829 316 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 IRF3Q14653 427 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAB41Q5JT25 222 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCNT1Q5JUK3 1230 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 DCST1Q5T197 706 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF280DQ6N043 979 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 BRINP3Q76B58 766 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 TAGAPQ8N103 731 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMTC2Q8N394 836 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 PGBD5Q8N414 524 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR8K5Q8NH50 307 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAGEC3Q8TD91 643 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRPC4APQ8TEL6 797 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 GRAMD2BQ96HH9 432 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 MED30Q96HR3 178 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 C3orf30Q96M34 536 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 NUDCD1Q96RS6 583 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 CSF3RQ99062 836 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 GAD1Q99259 594 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZPBPQ9BS86 351 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPRY4Q9C004 299 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 SIL1Q9H173 461 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 MCM9Q9NXL9 1143 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 TERF2IPQ9NYB0 399 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF224Q9NZL3 707 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 C1RLQ9NZP8 487 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 COPG2Q9UBF2 871 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 SIX4Q9UIU6 781 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACSL5Q9ULC5 683 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 NENFQ9UMX5 172 aa2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms