RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 DPPA4Q7L190 304 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 CMC1Q7Z7K0 106 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 PIANPQ8IYJ0 282 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 TCP10LQ8TDR4 215 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP1R16AQ96I34 528 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 CAB39LQ9H9S4 337 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 IL26Q9NPH9 171 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC39A10Q9ULF5 831 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 CKAP5Q14008 2032 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 SPAM1P38567 509 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 CACNG1Q06432 222 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGEF7Q14155 803 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 TM9SF1O15321 606 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 SRP72O76094 671 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 MPOP05164 745 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 IL9P15248 144 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 PMLP29590 882 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 CRHR1P34998 444 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP24.81■■□□□ 1.56
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CAPNS1-215ENST00000628018 TDGQ13569 410 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 USP10Q14694 798 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR26Q8NDV2 337 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 MGARPQ8TDB4 240 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 MSANTD3Q96H12 275 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 CABS1Q96KC9 395 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 GABRG3Q99928 467 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 OMDQ99983 421 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC13A1Q9BZW2 595 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM96AQ9H5X1 160 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM50BQ9Y247 325 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 LOC730098B7Z3J9 87 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 PRAMEF1O95521 474 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 SRFP11831 508 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 NTSR1P30989 418 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 MMP12P39900 470 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 CCT5P48643 541 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 TTPAP49638 278 aa24.8■■□□□ 1.56
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CAPNS1-215ENST00000628018 POU4F1Q01851 419 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 PPM1JQ5JR12 505 aa24.8■■□□□ 1.56
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CAPNS1-215ENST00000628018 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
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CAPNS1-215ENST00000628018 ERAP2Q6P179 960 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM151BQ6UXP7 276 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 GPATCH11Q8N954 259 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 ELMO2Q96JJ3 720 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 PSD3Q9NYI0 1048 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 CRYL1Q9Y2S2 319 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 MYO10Q9HD67 2058 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 SHISA7A6NL88 538 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 SPINT1O43278 529 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 ASMTLO95671 621 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 C2P06681 752 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 SPINT3P49223 89 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 SUOXP51687 545 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 GNGT1P63211 74 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC14Q15048 493 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 C2orf27AQ580R0 203 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM46CQ5VWP2 391 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 SNX20Q7Z614 316 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 IL17RCQ8NAC3 791 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 LPGAT1Q92604 370 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 MLXIPLQ9NP71 852 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 PKD2L2Q9NZM6 624 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC17A7Q9P2U7 560 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A096LPK6 155 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 PSMD8P48556 350 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 TAS2R39P59534 338 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB10P61026 200 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 NFATC2Q13469 925 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF549Q6P9A3 640 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXL19Q6PCT2 694 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 RFLNAQ6ZTI6 216 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 CEP97Q8IW35 865 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 NDNQ99608 321 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 HDAC8Q9BY41 377 aa24.78■■□□□ 1.56
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