RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 STMND1H3BQB6 276 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 RARAP10276 462 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 MMP13P45452 471 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 ARSDP51689 593 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 LIMK2P53671 638 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 KLHL30Q0D2K2 578 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 SQSTM1Q13501 440 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP24.84■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 OR4D9Q8NGE8 314 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 PIH1D2Q8WWB5 315 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 GBP4Q96PP9 640 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 TAAR9Q96RI9 348 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 SEMA3CQ99985 751 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 ISCUQ9H1K1 167 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 SDK2Q58EX2 2172 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 SOD1P00441 154 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 SFTPCP11686 197 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 CTPS1P17812 591 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 GPR1P46091 355 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 CYP4F2P78329 520 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 TYRO3Q06418 890 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 NKAIN2Q5VXU1 208 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 DOK6Q6PKX4 331 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 RFLNAQ6ZTI6 216 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 HTR3CQ8WXA8 447 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 CDH19Q9H159 772 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 ABCG8Q9H221 673 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 PCDH18Q9HCL0 1135 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPRF-216ENST00000617451 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 A0A0U1RQS6 177 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 PDHA1P08559 390 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 SKILP12757 684 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 SERPINB6P35237 376 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 ACTR1BP42025 376 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 CSRP3P50461 194 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 ACTR1AP61163 376 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC183Q5T5S1 534 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 TEX26Q8N6G2 289 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 TEKT4Q8WW24 435 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 PMEPA1Q969W9 287 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 AP2M1Q96CW1 435 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 CD84Q9UIB8 345 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 FZD6O60353 706 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 FILIP1LQ4L180 1135 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC66Q68CR7 880 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 NLRP8Q86W28 1048 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 AGBL5Q8NDL9 886 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 NKD1Q969G9 470 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 OR2M4Q96R27 311 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 DPYSL5Q9BPU6 564 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 BPIFA3Q9BQP9 254 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 NT5MQ9NPB1 228 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 THRAP10827 490 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 CSF2RBP32927 897 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 NFKB2Q00653 900 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 PTSQ03393 145 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 ANO6Q4KMQ2 910 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 PYCR3Q53H96 274 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC49Q8IUZ0 686 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 NDUFAF2Q8N183 169 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 NIPA2Q8N8Q9 360 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 SCAMP4Q969E2 229 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 SMIM14Q96QK8 99 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 FUCA2Q9BTY2 467 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 KCNK4Q9NYG8 393 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 IL17BQ9UHF5 180 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 TERTO14746 1132 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 IL4RP24394 825 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP24.79■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 FASLGP48023 281 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 ATP1A2P50993 1020 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF765Q7L2R6 523 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM74Q86UV6 250 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC112Q8NEF3 446 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 ART4Q93070 314 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 DDA1Q9BW61 102 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 SLC12A9Q9BXP2 914 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM4Q9C037 500 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM9Q9P0T7 183 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 A0A0J9YYE9 177 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1B0GTH6 734 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 SUV39H1O43463 412 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 TRBC1P01850 177 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF30P17039 623 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 MPSTP25325 297 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 UGT1A3P35503 534 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 GPLD1P80108 840 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRF-216ENST00000617451 CLCA4Q14CN2 919 aa24.78■■□□□ 1.56
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