RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559770.1

MFGE8-211, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 2

Gene MFGE8, Length 680 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-211ENST00000559770 TSPAN33Q86UF1 283 aa12.9□□□□□ -0.34
MFGE8-211ENST00000559770 ARL14Q8N4G2 192 aa12.9□□□□□ -0.34
MFGE8-211ENST00000559770 ARRDC2Q8TBH0 407 aa12.9□□□□□ -0.34
MFGE8-211ENST00000559770 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
MFGE8-211ENST00000559770 RAPGEF5Q92565 580 aa12.9□□□□□ -0.34
MFGE8-211ENST00000559770 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
MFGE8-211ENST00000559770 WDR26Q9H7D7 661 aa12.9□□□□□ -0.34
MFGE8-211ENST00000559770 ABHD10Q9NUJ1 306 aa12.9□□□□□ -0.34
MFGE8-211ENST00000559770 WDR70Q9NW82 654 aa12.9□□□□□ -0.34
MFGE8-211ENST00000559770 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
MFGE8-211ENST00000559770 SIRPGQ9P1W8 387 aa12.9□□□□□ -0.34
MFGE8-211ENST00000559770 GULP1Q9UBP9 304 aa12.9□□□□□ -0.34
MFGE8-211ENST00000559770 AMACRQ9UHK6 382 aa12.9□□□□□ -0.34
MFGE8-211ENST00000559770 GPR34Q9UPC5 381 aa12.9□□□□□ -0.34
MFGE8-211ENST00000559770 SCN8AQ9UQD0 1980 aa12.9□□□□□ -0.34
MFGE8-211ENST00000559770 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 A0A0U1RQS6 177 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 PRSS38A1L453 326 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 CLEC18AA5D8T8 446 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 ZNF487B1APH4 448 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 NOBOXO60393 691 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 MFAP3LO75121 409 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 TNFSF15O95150 251 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 PRLP01236 227 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 FUCA1P04066 466 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 CEACAM5P06731 702 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 SFTPCP11686 197 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 CTPS1P17812 591 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 CES1P23141 567 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 KDELR1P24390 212 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 NFKBIAP25963 317 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 DSC2Q02487 901 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 DPTQ07507 201 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 NIPAL4Q0D2K0 466 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 CLEC18BQ6UXF7 455 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 Q6ZVL8 140 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 USP45Q70EL2 814 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 HEATR4Q86WZ0 1026 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 MAP7D3Q8IWC1 876 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 CLEC18CQ8NCF0 446 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 CCL4L1Q8NHW4 92 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 SLC35G2Q8TBE7 412 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 CCDC74AQ96AQ1 378 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 HDAC11Q96DB2 347 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 SGF29Q96ES7 293 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 RNF157Q96PX1 679 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 SMIM14Q96QK8 99 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 TMEM168Q9H0V1 697 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 TSPY26PQ9H489 355 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 SPTLC3Q9NUV7 552 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP12.89□□□□□ -0.351e-6■■■□□ 15.8
MFGE8-211ENST00000559770 DTLQ9NZJ0 730 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 A0A0J9YYE9 177 aa12.88□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 AKR1B10O60218 316 aa12.88□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 SOD1P00441 154 aa12.88□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 TRBC1P01850 177 aa12.88□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 HLA-DQB2P05538 268 aa12.88□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 CCNB1P14635 433 aa12.88□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 ARHGAP25P42331 645 aa12.88□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 INHBCP55103 352 aa12.88□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 CDK3Q00526 305 aa12.88□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 PTSQ03393 145 aa12.88□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 ARHGEF7Q14155 803 aa12.88□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 MESDQ14696 234 aa12.88□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 TCEAL1Q15170 157 aa12.88□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 TGIF1Q15583 401 aa12.88□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 DENND2CQ68D51 928 aa12.88□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 RFLNAQ6ZTI6 216 aa12.88□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 TAF8Q7Z7C8 310 aa12.88□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 VSIG1Q86XK7 387 aa12.88□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 NRROSQ86YC3 692 aa12.88□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 SFTPA2Q8IWL1 248 aa12.88□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 PLD5Q8N7P1 536 aa12.88□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 OR6C4Q8NGE1 309 aa12.88□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 GPBAR1Q8TDU6 330 aa12.88□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 LRRN4Q8WUT4 740 aa12.88□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa12.88□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 DEF6Q9H4E7 631 aa12.88□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 CYP4F12Q9HCS2 524 aa12.88□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 ICE1Q9Y2F5 2266 aa12.87□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 A0A1W2PQM1 296 aa12.87□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 MMP2P08253 660 aa12.87□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 PNLIPP16233 465 aa12.87□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 GLB1P16278 677 aa12.87□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 ZNF30P17039 623 aa12.87□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 MX2P20592 715 aa12.87□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 STC1P52823 247 aa12.87□□□□□ -0.35
MFGE8-211ENST00000559770 CCL7P80098 99 aa12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms