RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548025.5

MARF1-205, Transcript of meiosis regulator and mRNA stability factor 1, human

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MARF1, Length 5,891 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MARF1-205	ENST00000548025	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
MARF1-205	ENST00000548025	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MARF1-205	ENST00000548025	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MARF1-205	ENST00000548025		E9PAM4	449 aa		10.65	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	BTN3A1	O00481	513 aa		10.65	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	CSK	P41240	450 aa		10.65	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	DIO3	P55073	304 aa		10.65	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	ANTXR2	P58335	489 aa		10.65	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	SMIM11A	P58511	58 aa		10.65	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	PLP2	Q04941	152 aa		10.65	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	MGAT5	Q09328	741 aa		10.65	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		10.65	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		10.65	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		10.65	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		10.65	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	PROSC	O94903	275 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	THEGL	P0DJG4	465 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	SRF	P11831	508 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	SEPHS1	P49903	392 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	RNF44	Q7L0R7	432 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	HMCES	Q96FZ2	354 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	LILRA4	P59901	499 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	RFX8	Q6ZV50	586 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	RADIL	Q96JH8	1075 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	GFRA3	O60609	400 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	COQ9	O75208	318 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	CASP9	P55211	416 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	OVGP1	Q12889	678 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	FAM187B	Q17R55	369 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	GPAT3	Q53EU6	434 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	CST9	Q5W186	159 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	FAM171B	Q6P995	826 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	SLC35F6	Q8N357	371 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	PAPPA	Q13219	1627 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	ILVBL	A1L0T0	632 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	PI15	O43692	258 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	GLRB	P48167	497 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	GSTM4	Q03013	218 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	SMPDL3B	Q92485	455 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	KCNK13	Q9HB14	408 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	PISD	Q9UG56	409 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	C5orf60	A6NFR6	353 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	SERPINB1	P30740	379 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	CLCN1	P35523	988 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	IL10RB	Q08334	325 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	STK4	Q13043	487 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	NR1D2	Q14995	579 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	NR6A1	Q15406	480 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	SLC5A8	Q8N695	610 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	TOP1MT	Q969P6	601 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	ADGRB1	O14514	1584 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	10.63	□□□□□ -0.71	2e-6	■□□□□ 10.3
MARF1-205	ENST00000548025	MAGEB3	O15480	346 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	LARGE1	O95461	756 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MARF1-205	ENST00000548025	GOT1	P17174	413 aa		10.63	□□□□□ -0.71

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