RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492739.1

NDUFB4-205, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NDUFB4, Length 309 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB4-205ENST00000492739 SPO11Q9Y5K1 396 aa9.51□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 TEX264Q9Y6I9 313 aa9.51□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa9.51□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 FAM169AQ9Y6X4 670 aa9.51□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 CACNA1HO95180 2353 aa9.51□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 MYLKQ15746 1914 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 CACNA1EQ15878 2313 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 KLHL33A6NCF5 533 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 FAM86C2PA6NEL3 165 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 GOLGA8CPA6NN73 597 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 CFAP99D6REC4 459 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 QSOX1O00391 747 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 PLK4O00444 970 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 TP73O15350 636 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 SPINT1O43278 529 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 FSBPO95073 299 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 RALBP11234 206 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 LHCGRP22888 699 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 HTR1BP28222 390 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 ELK3P41970 407 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 GRIA1P42261 906 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 MAGEA4P43358 317 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 RABIFP47224 123 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 PXNP49023 591 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 CARSP49589 748 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 TTPAP49638 278 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 METAP1P53582 386 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 RACK1P63244 317 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 CACNG1Q06432 222 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 BRD3Q15059 726 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 LONRF1Q17RB8 773 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 LDLRAP1Q5SW96 308 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 LYSMD4Q5XG99 296 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 ZDHHC24Q6UX98 284 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 KIAA0408Q6ZU52 694 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 Q6ZVL8 140 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 SNX20Q7Z614 316 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 TSPAN33Q86UF1 283 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 ZBED8Q8IZ13 594 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 MFSD2AQ8NA29 543 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 ZNF398Q8TD17 642 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 RLN3Q8WXF3 142 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 BIRC7Q96CA5 298 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 VPS35Q96QK1 796 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 FAM167BQ9BTA0 163 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 RMI1Q9H9A7 625 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 PPCSQ9HAB8 311 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 SAYSD1Q9NPB0 183 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 TREX1Q9NSU2 369 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 SMOXQ9NWM0 555 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 SYBUQ9NX95 663 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 RAB21Q9UL25 225 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 NFU1Q9UMS0 254 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 ARL5AQ9Y689 179 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa9.5□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 ESYT3A0FGR9 886 aa9.49□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 PRR23AA6NEV1 266 aa9.49□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 A6NNZ2 444 aa9.49□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 A8MX80 341 aa9.49□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 TNFRSF10CO14798 259 aa9.49□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 DFNA5O60443 496 aa9.49□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 AVILO75366 819 aa9.49□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 SRP72O76094 671 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 IGHV4-34P06331 123 aa9.49□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 GSTM1P09488 218 aa9.49□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 C1SP09871 688 aa9.49□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 PIRTP0C851 137 aa9.49□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 BPIP17213 487 aa9.49□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 STX2P32856 288 aa9.49□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 TRIM23P36406 574 aa9.49□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 ETV3P41162 512 aa9.49□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 GPR1P46091 355 aa9.49□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 TERF1P54274 439 aa9.49□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 GSTM4Q03013 218 aa9.49□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 NAB1Q13506 487 aa9.49□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 PEX6Q13608 980 aa9.49□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 ITIH4Q14624 930 aa9.49□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 PLK5Q496M5 336 aa9.49□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 FNBP1LQ5T0N5 605 aa9.49□□□□□ -0.89
NDUFB4-205ENST00000492739 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms