RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486261.5

KRIT1-222, Transcript of KRIT1, ankyrin repeat containing, human

TSL 1 (best)

Gene KRIT1, Length 4,057 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KRIT1-222	ENST00000486261	SPDL1	Q96EA4	605 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	HAPLN3	Q96S86	360 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	KCNK16	Q96T55	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	IFT22	Q9H7X7	185 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	IL37	Q9NZH6	218 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	KLHL3	Q9UH77	587 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	FZD4	Q9ULV1	537 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CYP26A1	O43174	497 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	GPR39	O43194	453 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	BUB1	O43683	1085 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	FAM189A1	O60320	539 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	SRGAP2	O75044	1071 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	PEX11A	O75192	247 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	MOSPD3	O75425	235 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	PRKD3	O94806	890 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ANXA6	P08133	673 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	HSD3B1	P14060	373 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	PRKACA	P17612	351 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ARL3	P36405	182 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	P2RY2	P41231	377 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	GRIA4	P48058	902 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	MAPKAPK2	P49137	400 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CCR5	P51681	352 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	RAD23B	P54727	409 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	UCN	P55089	124 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	PPP3CA	Q08209	521 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	KRT81	Q14533	505 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF235	Q14590	738 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ZMYND11	Q15326	602 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	MTFR2	Q6P444	385 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	FAM124A	Q86V42	546 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	FBXO30	Q8TB52	745 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	HTRA1	Q92743	480 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	NAT6	Q93015	286 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	NXPE2	Q96DL1	559 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	TEX12	Q9BXU0	123 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	SPAST	Q9UBP0	616 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	MYO10	Q9HD67	2058 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	FAM92A	A1XBS5	289 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	RAMP2	O60895	175 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	RTN2	O75298	545 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	LRRN2	O75325	713 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	KRT7	P08729	469 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	PDGFRA	P16234	1089 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CES1	P23141	567 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ALDH4A1	P30038	563 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ASPA	P45381	313 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	HAAO	P46952	286 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	PSMD8	P48556	350 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	GPR85	P60893	370 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	DOC2A	Q14183	400 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	SPA17	Q15506	151 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ST3GAL2	Q16842	350 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	TMEM25	Q86YD3	366 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CMTM3	Q96MX0	182 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms