RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 GCAP28676 217 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 NOS3P29474 1203 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 GPC1P35052 558 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 SPAM1P38567 509 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 EIF1P41567 113 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 NME5P56597 212 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 SPCS3P61009 180 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 ROR1Q01973 937 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 CNTN2Q02246 1040 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC18A2Q05940 514 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 IKBKEQ14164 716 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 SSX2Q16385 188 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 RTN1Q16799 776 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 MGAT5BQ3V5L5 792 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 LRRC24Q50LG9 513 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 KLHL12Q53G59 568 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 SLFN12LQ6IEE8 588 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 C16orf89Q6UX73 402 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 H2AFVQ71UI9 128 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 DYMQ7RTS9 669 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 BTLAQ7Z6A9 289 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC9B2Q86UD5 537 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 C12orf40Q86WS4 652 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM71DQ8N9W8 422 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 ATG16L2Q8NAA4 619 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 C11orf65Q8NCR3 313 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 OR10T2Q8NGX3 314 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 FBXO27Q8NI29 283 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 ZFP90Q8TF47 636 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 COPS5Q92905 334 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 RNF170Q96K19 258 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 BTN2A3PQ96KV6 586 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 CCM2Q9BSQ5 444 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 MND1Q9BWT6 205 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 BLZF1Q9H2G9 400 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 PIGUQ9H490 435 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 PRDM9Q9NQV7 894 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 KLHL1Q9NR64 748 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 ABCB10Q9NRK6 738 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 SNX15Q9NRS6 342 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 PLSCR3Q9NRY6 295 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 RGS18Q9NS28 235 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 NINJ2Q9NZG7 142 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 BOLA1Q9Y3E2 137 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 DMRT1Q9Y5R6 373 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 TRPV2Q9Y5S1 764 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 LAMA4Q16363 1823 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A1B0GTW7 788 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 TRIM49BA6NDI0 452 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 ERVV-1B6SEH8 477 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 ADM5C9JUS6 153 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC7A4O43246 635 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 FZD6O60353 706 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 RBBP9O75884 186 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 SEC24AO95486 1093 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 MMP1P03956 469 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 PROCP04070 461 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 PLA2G4BP0C869 781 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 MATN1P21941 496 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 CBLP22681 906 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 COILP38432 576 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 CD86P42081 329 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 RPS5P46782 204 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 SEPHS1P49903 392 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 HLCSP50747 726 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 P2RY4P51582 365 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF91Q05481 1191 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC13A2Q13183 592 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 TNK1Q13470 666 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 RAPSNQ13702 412 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 XKR3Q5GH77 459 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 ARMCX4Q5H9R4 360 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 LDLRAP1Q5SW96 308 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 SEL1L2Q5TEA6 688 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 BROXQ5VW32 411 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM160B1Q5W0V3 765 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 TIGD3Q6B0B8 471 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 CFAP161Q6P656 301 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 ERICH5Q6P6B1 374 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF790Q6PG37 636 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 CRTC3Q6UUV7 619 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 C16orf86Q6ZW13 317 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-208ENST00000471759 SNX20Q7Z614 316 aa6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.7 ms