RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 LTB4R2Q9NPC1 389 aa3.14□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 STON1Q9Y6Q2 735 aa3.14□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 I6L893 689 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 JRKO75564 520 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 OAZ2O95190 189 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 FTCDO95954 541 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 ALPLP05186 524 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 ADRB2P07550 413 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 ACTN1P12814 892 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 DDX5P17844 614 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 IL11P20809 199 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 MAOAP21397 527 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 PON1P27169 355 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 HOXC9P31274 260 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 THPOP40225 353 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 PIK3CAP42336 1068 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 CAMPP49913 170 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 CLCN3P51790 818 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 GALCP54803 685 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 ACSM2AQ08AH3 577 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 TRAF1Q13077 416 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 NEDD9Q14511 834 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 NAB2Q15742 525 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 ACSM2BQ68CK6 577 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 ANKRD54Q6NXT1 300 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 PQLC2Q6ZP29 291 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 Q6ZSV7 163 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 ADGRA1Q86SQ6 560 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 TSPAN33Q86UF1 283 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 TRIB2Q92519 343 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 IGSF8Q969P0 613 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 JAKMIP2Q96AA8 810 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 APOLD1Q96LR9 279 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 ACOX2Q99424 681 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 CENPOQ9BU64 300 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 PLAC1Q9HBJ0 212 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM51Q9NW97 253 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 MORF4L1Q9UBU8 362 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 VWA5AO00534 786 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 CSPG5O95196 566 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 CYP1A2P05177 515 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 SELLP14151 372 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 HTR6P50406 440 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 PMS2P54278 862 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 LRMPQ12912 555 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 MYBPC2Q14324 1141 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 GPR18Q14330 331 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 NTRK2Q16620 822 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 MFSD4BQ5TF39 518 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 DPPA4Q7L190 304 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF367Q7RTV3 350 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 POC5Q8NA72 575 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 OR14L1PQ8NHC6 308 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 TRPC4APQ8TEL6 797 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 OIT3Q8WWZ8 545 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 ERGIC1Q969X5 290 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 ELMOD3Q96FG2 381 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 SH3GL2Q99962 352 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 SLF1Q9BQI6 1058 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 GIMAP4Q9NUV9 329 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 SETD4Q9NVD3 440 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 OR6C3Q9NZP0 311 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 NENFQ9UMX5 172 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 OR2A25A4D2G3 310 aa3.12□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 VCYO14598 125 aa3.12□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 SPRY3O43610 288 aa3.12□□□□□ -1.91
CCDC82-202ENST00000423339 ENTPD3O75355 529 aa3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms