RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372071.6

OPN4-202, Transcript of opsin 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN4, Length 2,401 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4-202ENST00000372071 TRIM43BA6NCK2 446 aa14.77□□□□□ -0.04
OPN4-202ENST00000372071 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
OPN4-202ENST00000372071 IQCF5A8MTL0 148 aa14.77□□□□□ -0.04
OPN4-202ENST00000372071 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
OPN4-202ENST00000372071 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa14.77□□□□□ -0.04
OPN4-202ENST00000372071 CFLARO15519 480 aa14.77□□□□□ -0.04
OPN4-202ENST00000372071 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
OPN4-202ENST00000372071 CNPP09543 421 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
OPN4-202ENST00000372071 MTHFD2P13995 350 aa14.77□□□□□ -0.04
OPN4-202ENST00000372071 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
OPN4-202ENST00000372071 LPOP22079 712 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
OPN4-202ENST00000372071 LAMB3Q13751 1172 aa14.77□□□□□ -0.04
OPN4-202ENST00000372071 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
OPN4-202ENST00000372071 PGM2L1Q6PCE3 622 aa14.77□□□□□ -0.04
OPN4-202ENST00000372071 AFTPHQ6ULP2 937 aa14.77□□□□□ -0.04
OPN4-202ENST00000372071 GK5Q6ZS86 529 aa14.77□□□□□ -0.04
OPN4-202ENST00000372071 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
OPN4-202ENST00000372071 TCEAL8Q8IYN2 117 aa14.77□□□□□ -0.04
OPN4-202ENST00000372071 DDI1Q8WTU0 396 aa14.77□□□□□ -0.04
OPN4-202ENST00000372071 PEX13Q92968 403 aa14.77□□□□□ -0.04
OPN4-202ENST00000372071 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
OPN4-202ENST00000372071 EID2BQ96D98 161 aa14.77□□□□□ -0.04
OPN4-202ENST00000372071 CCDC126Q96EE4 140 aa14.77□□□□□ -0.04
OPN4-202ENST00000372071 NPAS2Q99743 824 aa14.77□□□□□ -0.04
OPN4-202ENST00000372071 RTKNQ9BST9 563 aa14.77□□□□□ -0.04
OPN4-202ENST00000372071 HSFX1Q9UBD0 423 aa14.77□□□□□ -0.04
OPN4-202ENST00000372071 GIMAP2Q9UG22 337 aa14.77□□□□□ -0.04
OPN4-202ENST00000372071 OR51B4Q9Y5P0 310 aa14.77□□□□□ -0.04
OPN4-202ENST00000372071 A0A1B0GTL3 188 aa14.77□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 GOLGA8CPA6NN73 597 aa14.77□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 A8MX80 341 aa14.77□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 F8W8V4 182 aa14.77□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 CDC7O00311 574 aa14.77□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 TGM5O43548 720 aa14.77□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 CKMP06732 381 aa14.77□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 THRAP10827 490 aa14.77□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 ANPEPP15144 967 aa14.77□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 PRDX6P30041 224 aa14.77□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 SEMG2Q02383 582 aa14.77□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 CCNIQ14094 377 aa14.77□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 MUM1Q2TAK8 710 aa14.77□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 BBS7Q8IWZ6 715 aa14.77□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 ALG14Q96F25 216 aa14.77□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 CCDC28BQ9BUN5 200 aa14.77□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 TLR9Q9NR96 1032 aa14.77□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 SAGE1Q9NXZ1 904 aa14.77□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 POMPQ9Y244 141 aa14.77□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 TRAF6Q9Y4K3 522 aa14.77□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 LRRC42Q9Y546 428 aa14.77□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 ANKRD12Q6UB98 2062 aa14.77□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 NVLO15381 856 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 STX7O15400 261 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 HK2P52789 917 aa14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 FOXA1P55317 472 aa14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 PKNOX1P55347 436 aa14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 SH3BP2P78314 561 aa14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 TSNQ15631 228 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 CYHR1Q6ZMK1 362 aa14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 SLC22A9Q8IVM8 553 aa14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 MFN1Q8IWA4 741 aa14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 KBTBD2Q8IY47 623 aa14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 DSELQ8IZU8 1212 aa14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 SLC26A7Q8TE54 656 aa14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 ESAMQ96AP7 390 aa14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 C3orf30Q96M34 536 aa14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 BIRC8Q96P09 236 aa14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 KCNA7Q96RP8 456 aa14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 ADGRE3Q9BY15 652 aa14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 CCDC68Q9H2F9 335 aa14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 ZBTB26Q9HCK0 441 aa14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 CFAP97Q9P2B7 532 aa14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 STOML2Q9UJZ1 356 aa14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 A0A1W2PRU2 124 aa14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 TRPC5OSA6NMA1 111 aa14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 SMIM24O75264 130 aa14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 GFAPP14136 432 aa14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 LAG3P18627 525 aa14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 CA5AP35218 305 aa14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 VHLP40337 213 aa14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 SUOXP51687 545 aa14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 HERVK_113P63132 956 aa14.76□□□□□ -0.05
OPN4-202ENST00000372071 Q6ZNB5 142 aa14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms