RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362817.1

RNU1-38P-201, Transcript of RNA, U1 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU1-38P, Length 144 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU1-38P-201ENST00000362817 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 AFMIDQ63HM1 303 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 RETSATQ6NUM9 610 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 C22orf39Q6P5X5 142 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 LEKR1Q6ZMV7 388 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 RFX8Q6ZV50 586 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 USP30Q70CQ3 517 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 POLNQ7Z5Q5 900 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM124AQ86V42 546 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 AADATQ8N5Z0 425 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 NPWQ8N729 165 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 CHST14Q8NCH0 376 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR2A12Q8NGT7 310 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC35G2Q8TBE7 412 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 TEKT4Q8WW24 435 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 HSPH1Q92598 858 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 HMCESQ96FZ2 354 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 PWWP2AQ96N64 755 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 GPR174Q9BXC1 333 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZWILCHQ9H900 591 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM74BQ9NUR3 256 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 SIRPGQ9P1W8 387 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 SARDHQ9UL12 918 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 INTUQ9ULD6 942 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 SCML1Q9UN30 329 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 TFR2Q9UP52 801 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF292O60281 2723 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 SPAG17Q6Q759 2223 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 NUP205Q92621 2012 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 C10orf142B7Z368 130 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 RASA4BC9J798 803 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 PLK4O00444 970 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 MCF2LO15068 1137 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 ALOX15BO15296 676 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 PDPK1O15530 556 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 RASA4O43374 803 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 NDUFS2O75306 463 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 MTA2O94776 668 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 IL1BP01584 269 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 CD48P09326 243 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF806P0C7X5 589 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 C5AR1P21730 350 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 IL4RP24394 825 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 PMLP29590 882 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC8A1P32418 973 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 MAN1A1P33908 653 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 HCAR3P49019 387 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 NDST2P52849 883 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 TAS2R40P59535 323 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC20A2Q08357 652 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 LSAMPQ13449 338 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 SERINC3Q13530 473 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 MESDQ14696 234 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 PRSS53Q2L4Q9 553 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 PARP15Q460N3 678 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 DCAF12L1Q5VU92 463 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 LYSMD4Q5XG99 296 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 TCEAL6Q6IPX3 200 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 RHOT2Q8IXI1 618 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 CCDC170Q8IYT3 715 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 RCBTB1Q8NDN9 531 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 CADM4Q8NFZ8 388 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM71BQ8TC56 605 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 RFFLQ8WZ73 363 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR8D1Q8WZ84 308 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 PIGKQ92643 395 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 TCEAL3Q969E4 200 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM131CQ96AQ9 280 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 VOPP1Q96AW1 172 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 CSPG4P5Q96PW8 444 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 ANP32EQ9BTT0 268 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC39A8Q9C0K1 460 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 BTBD1Q9H0C5 482 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 NEUROG2Q9H2A3 272 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 PDFQ9HBH1 243 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 SGK2Q9HBY8 427 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 VPS45Q9NRW7 570 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 GPR27Q9NS67 375 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 RXFP3Q9NSD7 469 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 ETNK2Q9NVF9 386 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 FBXL12Q9NXK8 326 aa7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms