RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 THOP1P52888 689 aa24.12■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC80Q76M96 950 aa24.12■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 TBC1D3BA6NDS4 549 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 UGT2B17O75795 530 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 C9P02748 559 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 SP100P23497 879 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 HKDC1Q2TB90 917 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 LIN52Q52LA3 116 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 SDHAF4Q5VUM1 108 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 HGSNATQ68CP4 663 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 BTN2A1Q7KYR7 527 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM35AQ86V20 835 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 MUC13Q9H3R2 512 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 WNT7AO00755 349 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 TRMUO75648 421 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 HDCP19113 662 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 RAB25P57735 213 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 CPTPQ5TA50 214 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 FKBP1CQ5VVH2 108 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM171BQ6P995 826 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 SPOCK2Q92563 424 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 CLIP3Q96DZ5 547 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 PNPLA8Q9NP80 782 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 RASSF1Q9NS23 344 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 RGS10O43665 173 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 GRM5P41594 1212 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 TOMM20Q15388 145 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 PTPN20Q4JDL3 420 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 BICRALQ6AI39 1079 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 IRF2BP1Q8IU81 584 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 TOP6BLQ8N6T0 577 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 CPT1BQ92523 772 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 LPGAT1Q92604 370 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 RAD51AP1Q96B01 352 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 DPPA5A6NC42 116 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 BCAP31P51572 246 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 ITGA7Q13683 1181 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 BRMS1LQ5PSV4 323 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 ZYG11AQ6WRX3 759 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 CSPG4P5Q96PW8 444 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM39AQ9NV64 488 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 MAP10Q9P2G4 905 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 FOXO6A8MYZ6 492 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 CTSEP14091 401 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 C4orf32Q8N8J7 132 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 TWIST2Q8WVJ9 160 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa24.11■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.1■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa24.1■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 H0Y858 1186 aa24.1■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 ZW10O43264 779 aa24.1■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 RGS1Q08116 209 aa24.1■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa24.1■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 SOHLH2Q9NX45 425 aa24.1■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 PAGE1O75459 146 aa24.1■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 MAGP20916 626 aa24.1■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP4X1Q8N118 509 aa24.1■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 NXNL1Q96CM4 212 aa24.1■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM84AQ96KN4 292 aa24.1■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 RPP40O75818 363 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 TRBC1P01850 177 aa24.1■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 FCHO2Q0JRZ9 810 aa24.1■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 RAPSNQ13702 412 aa24.1■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 GRIK5Q16478 980 aa24.1■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 STRADAQ7RTN6 431 aa24.1■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC52Q8N7C0 313 aa24.1■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 CXorf40BQ96DE9 158 aa24.1■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 PPM1MQ96MI6 270 aa24.1■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 NEK6Q9HC98 313 aa24.1■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM25EA8MYX2 175 aa24.1■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 RPL9P32969 192 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 ALG11Q2TAA5 492 aa24.1■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa24.1■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 EFR3BQ9Y2G0 817 aa24.1■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 URADA6NGE7 173 aa24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 GJB1P08034 283 aa24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 PPM1JQ5JR12 505 aa24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 COPS8Q99627 209 aa24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF221Q9UK13 617 aa24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 IRAK3Q9Y616 596 aa24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 H3BNX3 289 aa24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms