RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563333.1

SNAP23-205, Transcript of synaptosome associated protein 23, humanhuman

TSL 2

Gene SNAP23, Length 862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23-205ENST00000563333 URADA6NGE7 173 aa4.56□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 IFNA2P01563 188 aa4.56□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 MMP3P08254 477 aa4.56□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 HOXB5P09067 269 aa4.56□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 GPR18Q14330 331 aa4.56□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 PTGR1Q14914 329 aa4.56□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 NAB2Q15742 525 aa4.56□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 ETFDHQ16134 617 aa4.56□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP4.56□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 USP41Q3LFD5 358 aa4.56□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 Q5PR19 223 aa4.56□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 C6orf141Q5SZD1 244 aa4.56□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 GARNL3Q5VVW2 1013 aa4.56□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 TICAM1Q8IUC6 712 aa4.56□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 SCYL3Q8IZE3 742 aa4.56□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 SPATA6LQ8N4H0 392 aa4.56□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 NANOGP1Q8N7R0 232 aa4.56□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 C7orf57Q8NEG2 295 aa4.56□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa4.56□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 ZFAND2BQ8WV99 257 aa4.56□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 SLC25A28Q96A46 364 aa4.56□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 PGAM5Q96HS1 289 aa4.56□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 ZFYVE19Q96K21 471 aa4.56□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 TMEM68Q96MH6 324 aa4.56□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 PCGF1Q9BSM1 259 aa4.56□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 HRH4Q9H3N8 390 aa4.56□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 OR6C3Q9NZP0 311 aa4.56□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 WDR35Q9P2L0 1181 aa4.56□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 TINAGQ9UJW2 476 aa4.56□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 UTYO14607 1347 aa4.55□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 A0A1B0GVT2 93 aa4.55□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 WDR91A4D1P6 747 aa4.55□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 CDRT15L2A8MXV6 281 aa4.55□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 B4DGG1 531 aa4.55□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 OGG1O15527 345 aa4.55□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 LCATP04180 440 aa4.55□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 TAS2R40P59535 323 aa4.55□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 TMF1P82094 1093 aa4.55□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 DCAF12L2Q5VW00 463 aa4.55□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 ADALQ6DHV7 355 aa4.55□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 PARM1Q6UWI2 310 aa4.55□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 LINGO2Q7L985 606 aa4.55□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 ASB5Q8WWX0 329 aa4.55□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 ZNF333Q96JL9 665 aa4.55□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 SLITRK1Q96PX8 696 aa4.55□□□□□ -1.68
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SNAP23-205ENST00000563333 MMP25Q9NPA2 562 aa4.55□□□□□ -1.68
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SNAP23-205ENST00000563333 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa4.55□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 CMAHPQ9Y471 501 aa4.55□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 TRPV2Q9Y5S1 764 aa4.55□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 HSPA12AO43301 675 aa4.54□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 ZIC3O60481 467 aa4.54□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 MITFO75030 526 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 DDNO94850 711 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 ZWINTO95229 277 aa4.54□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 C22orf31O95567 290 aa4.54□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 EGFP01133 1207 aa4.54□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 HOXB2P14652 356 aa4.54□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 GNLYP22749 145 aa4.54□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 LMO1P25800 156 aa4.54□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 ITGB8P26012 769 aa4.54□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 ABCG1P45844 678 aa4.54□□□□□ -1.68
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SNAP23-205ENST00000563333 TNFAIP1Q13829 316 aa4.54□□□□□ -1.68
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SNAP23-205ENST00000563333 ERMARDQ5T6L9 678 aa4.54□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa4.54□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 GPR139Q6DWJ6 353 aa4.54□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 SHFQ7M4L6 423 aa4.54□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 DNAAF5Q86Y56 855 aa4.54□□□□□ -1.68
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SNAP23-205ENST00000563333 MMP21Q8N119 569 aa4.54□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 C16orf52Q8NHV5 167 aa4.54□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 CSF3RQ99062 836 aa4.54□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa4.54□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 ERVK-11Q9UQG0 969 aa4.54□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 PASKQ96RG2 1323 aa4.53□□□□□ -1.68
SNAP23-205ENST00000563333 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa4.53□□□□□ -1.68
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