RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506197.2

SMIM20-201, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMIM20, Length 935 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-201ENST00000506197 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa20.09■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 SYBUQ9NX95 663 aa20.09■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 NFU1Q9UMS0 254 aa20.09■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 INVSQ9Y283 1065 aa20.09■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 SLC30A4O14863 429 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 GDF9O60383 454 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 NDUFS2O75306 463 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 CLDN7O95471 211 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF806P0C7X5 589 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 LHCGRP22888 699 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 ADRA1DP25100 572 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 LIG3P49916 1009 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 CNGA3Q16281 694 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 MAP7D1Q3KQU3 841 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 PCID2Q5JVF3 399 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 NEK5Q6P3R8 708 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 CCDC25Q86WR0 208 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 PWWP2AQ96N64 755 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 RANBP9Q96S59 729 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 TSPYL1Q9H0U9 437 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 TCAF1Q9Y4C2 921 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-201ENST00000506197 GON4LQ3T8J9 2241 aa20.08■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 DCDC2BA2VCK2 349 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 PSMD11O00231 422 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 MMP20O60882 483 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 LPOP22079 712 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 TNFRSF8P28908 595 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 RPS21P63220 83 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 CRADDP78560 199 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 ACOX1Q15067 660 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 CCDC38Q502W7 563 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 PLA2G2CQ5R387 149 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 ARMC3Q5W041 872 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 LIPIQ6XZB0 460 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 SLC36A4Q6YBV0 504 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 NLRP9Q7RTR0 991 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 LRRC39Q96DD0 335 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 GPR174Q9BXC1 333 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 PHACTR1Q9C0D0 580 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 SMOC1Q9H4F8 434 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 PKD2L2Q9NZM6 624 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 PKP3Q9Y446 797 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 ARL5AQ9Y689 179 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 DOCK9Q9BZ29 2069 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 PLXNA2O75051 1894 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 TPRP12270 2363 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 A0A0U1RQS6 177 aa20.06■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 A0A1W2PQU0 124 aa20.06■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 MAGEB16A2A368 324 aa20.06■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 AURKAO14965 403 aa20.06■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 STX7O15400 261 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 MAP3K13O43283 966 aa20.06■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 C6P13671 934 aa20.06■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 BCKDHBP21953 392 aa20.06■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 STC1P52823 247 aa20.06■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 CREB5Q02930 508 aa20.06■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 CDKN3Q16667 212 aa20.06■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 MSS51Q4VC12 460 aa20.06■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 PMS2CLQ68D20 193 aa20.06■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 TMC3Q7Z5M5 1100 aa20.06■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 MPP5Q8N3R9 675 aa20.06■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 TTC30BQ8N4P2 665 aa20.06■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa20.06■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 SAYSD1Q9NPB0 183 aa20.06■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 LDB2O43679 373 aa20.05■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 BANF1O75531 89 aa20.05■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 TM7SF2O76062 418 aa20.05■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 TUBBP07437 444 aa20.05■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 C1SP09871 688 aa20.05■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 HMGCLP35914 325 aa20.05■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 WDR93Q6P2C0 686 aa20.05■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 HORMAD1Q86X24 394 aa20.05■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 SIGLEC10Q96LC7 697 aa20.05■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 NAT9Q9BTE0 207 aa20.05■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 RAD18Q9NS91 495 aa20.05■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 SOX13Q9UN79 622 aa20.05■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 CHMP2BQ9UQN3 213 aa20.05■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 PI4KAP42356 2102 aa20.05■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 CCDC78A2IDD5 438 aa20.04■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 IGLON5A6NGN9 336 aa20.04■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 E7ESA3 106 aa20.04■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 BUD23O43709 281 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 ECHS1P30084 290 aa20.04■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 ELK3P41970 407 aa20.04■□□□□ 0.8
SMIM20-201ENST00000506197 LIMK1P53667 647 aa20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms