RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428918.1

CDH23-AS1-201, CDH23 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH23-AS1, Length 378 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PRSS38A1L453 326 aa16.21■□□□□ 0.19
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MT-CO3P00414 261 aa16.21■□□□□ 0.19
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GM2AP17900 193 aa16.21■□□□□ 0.19
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CYP4F3Q08477 520 aa16.21■□□□□ 0.19
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GUSBP11Q6P575 273 aa16.21■□□□□ 0.19
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC35F3Q8IY50 421 aa16.21■□□□□ 0.19
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa16.21■□□□□ 0.19
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EXD1Q8NHP7 514 aa16.21■□□□□ 0.19
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR1E3Q8WZA6 343 aa16.21■□□□□ 0.19
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP16.21■□□□□ 0.19
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LGR4Q9BXB1 951 aa16.21■□□□□ 0.19
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PKD2L2Q9NZM6 624 aa16.21■□□□□ 0.19
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PADI4Q9UM07 663 aa16.21■□□□□ 0.19
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MACROD2A1Z1Q3 448 aa16.2■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PTMAP06454 111 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CTNNA2P26232 953 aa16.2■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TEAD1P28347 426 aa16.2■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 VAV2P52735 878 aa16.2■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SKOR1P84550 965 aa16.2■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CDK3Q00526 305 aa16.2■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DPTQ07507 201 aa16.2■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP16.2■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BIRC2Q13490 618 aa16.2■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CAMK2BQ13554 666 aa16.2■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PTPRRQ15256 657 aa16.2■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PCSK7Q16549 785 aa16.2■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF765Q7L2R6 523 aa16.2■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KDELC2Q7Z4H8 507 aa16.2■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NRSN1Q8IZ57 195 aa16.2■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CNTD1Q8N815 330 aa16.2■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa16.2■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SPC24Q8NBT2 197 aa16.2■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FAM46DQ8NEK8 389 aa16.2■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR6C4Q8NGE1 309 aa16.2■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 WDR48Q8TAF3 677 aa16.2■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KIAA1524Q8TCG1 905 aa16.2■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HAUS1Q96CS2 278 aa16.2■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TEX101Q9BY14 249 aa16.2■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GSDMCQ9BYG8 508 aa16.2■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NRSN2Q9GZP1 204 aa16.2■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC25A51Q9H1U9 297 aa16.2■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DPEP2Q9H4A9 486 aa16.2■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa16.19■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa16.19■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CCDC66A2RUB6 948 aa16.19■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ANKRD66B4E2M5 251 aa16.19■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KRT37O76014 449 aa16.19■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CLDN7O95471 211 aa16.19■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FECHP22830 423 aa16.19■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CDC25BP30305 580 aa16.19■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GNPDA1P46926 289 aa16.19■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 STC1P52823 247 aa16.19■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KIF5AQ12840 1032 aa16.19■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PEX6Q13608 980 aa16.19■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GALNT3Q14435 633 aa16.19■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PPP2R5EQ16537 467 aa16.19■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TAZQ16635 292 aa16.19■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TEX44Q53QW1 395 aa16.19■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DOK6Q6PKX4 331 aa16.19■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RAD9BQ6WBX8 426 aa16.19■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa16.19■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa16.19■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ACRBPQ8NEB7 543 aa16.19■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ABCG8Q9H221 673 aa16.19■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DKK4Q9UBT3 224 aa16.19■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 U3KQA8 63 aa16.19■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa16.19■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 A0A0U1RQS6 177 aa16.18■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BTNL10A8MVZ5 291 aa16.18■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 B4DGG1 531 aa16.18■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CSO75390 466 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ASMTLO95671 621 aa16.18■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PRLP01236 227 aa16.18■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC4A1P02730 911 aa16.18■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MMP2P08253 660 aa16.18■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MARCKSL1P49006 195 aa16.18■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RWDD2BP57060 319 aa16.18■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 COPS2P61201 443 aa16.18■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PTSQ03393 145 aa16.18■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CDK18Q07002 472 aa16.18■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 QPCTQ16769 361 aa16.18■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa16.18■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SYCE1Q8N0S2 351 aa16.18■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PELI3Q8N2H9 469 aa16.18■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KYQ8NBH2 561 aa16.18■□□□□ 0.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KRT35Q92764 455 aa16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms