RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 CTSLP07711 333 aa15.34■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 DLDP09622 509 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 PMLP29590 882 aa15.34■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 ALDH3A1P30838 453 aa15.34■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 HMGCLP35914 325 aa15.34■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 GLRBP48167 497 aa15.34■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 RPL26P61254 145 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 XIAPP98170 497 aa15.34■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP15.34■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 FCHO2Q0JRZ9 810 aa15.34■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 GRIN2CQ14957 1233 aa15.34■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 CRTC1Q6UUV9 634 aa15.34■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa15.34■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 OTOAQ7RTW8 1153 aa15.34■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 FAM136AQ96C01 138 aa15.34■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 ERLEC1Q96DZ1 483 aa15.34■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 CABS1Q96KC9 395 aa15.34■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 DEC1Q9P2X7 70 aa15.34■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 ACOT9Q9Y305 439 aa15.34■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 WASF2Q9Y6W5 498 aa15.34■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa15.34■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 OR1I1O60431 355 aa15.33■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 EDF1O60869 148 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 LEFTY1O75610 366 aa15.33■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 HLA-EP13747 358 aa15.33■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 FMO4P31512 558 aa15.33■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 NNMTP40261 264 aa15.33■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 POLD2P49005 469 aa15.33■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 STC1P52823 247 aa15.33■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 POU4F1Q01851 419 aa15.33■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 RAD51Q06609 339 aa15.33■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 OVGP1Q12889 678 aa15.33■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 RUNX3Q13761 415 aa15.33■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 ADGRE1Q14246 886 aa15.33■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 CHI3L2Q15782 390 aa15.33■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 CTC1Q2NKJ3 1217 aa15.33■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 POM121L1PQ3SYA9 428 aa15.33■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa15.33■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 AFTPHQ6ULP2 937 aa15.33■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM207Q6UWW9 146 aa15.33■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 GDPD4Q6W3E5 623 aa15.33■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 RFLNAQ6ZTI6 216 aa15.33■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 LMNTD2Q8IXW0 634 aa15.33■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM151AQ8N4L1 468 aa15.33■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 CHFRQ96EP1 664 aa15.33■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa15.33■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 HEPHQ9BQS7 1158 aa15.33■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 C20orf27Q9GZN8 174 aa15.33■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 PRO3102Q9H379 93 aa15.33■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 MTCH2Q9Y6C9 303 aa15.33■□□□□ 0.05
CASQ1-201ENST00000368078 WASH3PC4AMC7 463 aa15.33■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 SNX3O60493 162 aa15.33■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 GJA4P35212 333 aa15.33■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 OPRD1P41143 372 aa15.33■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 CLCN5P51795 746 aa15.33■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 SLC12A2P55011 1212 aa15.33■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 PCLAFQ15004 111 aa15.33■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 PDGFRLQ15198 375 aa15.33■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 GRAMD4Q6IC98 578 aa15.33■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 GALNT7Q86SF2 657 aa15.33■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 PIM3Q86V86 326 aa15.33■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 C10orf107Q8IVU9 208 aa15.33■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 YAF2Q8IY57 180 aa15.33■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 NAT14Q8WUY8 206 aa15.33■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 MOCOSQ96EN8 888 aa15.33■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 SCRN2Q96FV2 425 aa15.33■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 GPR78Q96P69 363 aa15.33■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 BRD9Q9H8M2 597 aa15.33■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 NMRAL1Q9HBL8 299 aa15.33■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 SIRPGQ9P1W8 387 aa15.33■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 PLA2G4CQ9UP65 541 aa15.33■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 PKP3Q9Y446 797 aa15.33■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 CAPN8A6NHC0 703 aa15.32■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 GSTA1P08263 222 aa15.32■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 SBK3P0C264 359 aa15.32■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 PSMC3P17980 439 aa15.32■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 OGNP20774 298 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 CRABP2P29373 138 aa15.32■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 GDI1P31150 447 aa15.32■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 PTSQ03393 145 aa15.32■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 TYSND1Q2T9J0 566 aa15.32■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 FAM151BQ6UXP7 276 aa15.32■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 TAS2R42Q7RTR8 314 aa15.32■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa15.32■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 ANKRD49Q8WVL7 239 aa15.32■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 E2F7Q96AV8 911 aa15.32■□□□□ 0.04
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.1 ms