RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 RDH11Q8TC12 318 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 C10orf82Q8WW14 230 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 SORCS1Q8WY21 1168 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 ECHDC3Q96DC8 303 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 ZFYVE19Q96K21 471 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 RMDN2Q96LZ7 410 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 C20orf27Q9GZN8 174 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 MID2Q9UJV3 735 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 USH1CQ9Y6N9 552 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 MYO9BQ13459 2157 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 REV3LO60673 3130 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 HEPACAM2A8MVW5 462 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 ANKRD65E5RJM6 399 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 TK2O00142 265 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 SERPINE1P05121 402 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 SBK3P0C264 359 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 ARSAP15289 507 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 GRK2P25098 689 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 NNMTP40261 264 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 HYAL1Q12794 435 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 CDKN3Q16667 212 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 C12orf40Q86WS4 652 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 PLPP6Q8IY26 295 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 OR2A12Q8NGT7 310 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 RFWD2Q8NHY2 731 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 MRGPRX3Q96LB0 322 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 CIPCQ9C0C6 399 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 KDM4CQ9H3R0 1056 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 EBF3Q9H4W6 596 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 ABCF3Q9NUQ8 709 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 DCTN4Q9UJW0 460 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 CAPN8A6NHC0 703 aa19.14■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 NDUFS3O75489 264 aa19.14■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 NFATC1O95644 943 aa19.14■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 MYL2P10916 166 aa19.14■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 SP100P23497 879 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 XIAPP98170 497 aa19.14■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 ITGA9Q13797 1035 aa19.14■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 FAM83EQ2M2I3 478 aa19.14■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa19.14■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 SYCE2Q6PIF2 218 aa19.14■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 CCDC91Q7Z6B0 441 aa19.14■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 PIANPQ8IYJ0 282 aa19.14■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 CHST14Q8NCH0 376 aa19.14■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 ZNF398Q8TD17 642 aa19.14■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 HEXDCQ8WVB3 486 aa19.14■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 LPGAT1Q92604 370 aa19.14■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 UBXN10Q96LJ8 280 aa19.14■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 FAM96AQ9H5X1 160 aa19.14■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 TRPV4Q9HBA0 871 aa19.14■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 IGSF5Q9NSI5 407 aa19.14■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 OBP2AQ9NY56 170 aa19.14■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 TARM1B6A8C7 271 aa19.13■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 TULP3O75386 442 aa19.13■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 CLDN7O95471 211 aa19.13■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 FDXRP22570 491 aa19.13■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 SLC1A6P48664 564 aa19.13■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 TTPAP49638 278 aa19.13■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 CSHL1Q14406 222 aa19.13■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 ANKRD54Q6NXT1 300 aa19.13■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 ZYG11AQ6WRX3 759 aa19.13■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 CRLF3Q8IUI8 442 aa19.13■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 OR6Y1Q8NGX8 325 aa19.13■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 FRS2Q8WU20 508 aa19.13■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 TIFAQ96CG3 184 aa19.13■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 SCRN2Q96FV2 425 aa19.13■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 LYSMD1Q96S90 227 aa19.13■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 C19orf43Q9BQ61 176 aa19.13■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 XPR1Q9UBH6 696 aa19.13■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa19.13■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa19.13■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 TTC34A8MYJ7 566 aa19.13■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 WASH3PC4AMC7 463 aa19.13■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 PFDN6O15212 129 aa19.13■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 ITM2AO43736 263 aa19.13■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 UGT2B4P06133 528 aa19.13■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 DLDP09622 509 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 CCDC166P0CW27 439 aa19.13■□□□□ 0.65
UPP1-201ENST00000331803 SLC26A3P40879 764 aa19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms