RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 MRNIPQ6NTE8 343 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 CHRDL2Q6WN34 429 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 TSPAN33Q86UF1 283 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 TNS4Q8IZW8 715 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF366Q8N895 744 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 CABS1Q96KC9 395 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 LYSMD1Q96S90 227 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 KXD1Q9BQD3 176 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 PPIL1Q9Y3C6 166 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 WASF2Q9Y6W5 498 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 A8MX80 341 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 STX7O15400 261 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 SNX3O60493 162 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 EDF1O60869 148 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 CLDN7O95471 211 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 CTSLP07711 333 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 BPGMP07738 259 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 STMN1P16949 149 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 OGNP20774 298 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 CLCN5P51795 746 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 CDKN2DP55273 166 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 POU4F1Q01851 419 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 PCLAFQ15004 111 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 PDGFRLQ15198 375 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 AFTPHQ6ULP2 937 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 RAPH1Q70E73 1250 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 TTC8Q8TAM2 541 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 GPR78Q96P69 363 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 PITPNM3Q9BZ71 974 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 GPR63Q9BZJ6 419 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 POMKQ9H5K3 350 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 ELOVL2Q9NXB9 296 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 PHTF1Q9UMS5 762 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 GSTA1P08263 222 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 SBK3P0C264 359 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 MC4RP32245 332 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 CA5AP35218 305 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 HECTD2Q5U5R9 776 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 CES5AQ6NT32 575 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 OTOAQ7RTW8 1153 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 SPATA6LQ8N4H0 392 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 KCTD4Q8WVF5 259 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 SCRN2Q96FV2 425 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 MSLNLQ96KJ4 702 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM96AQ9H5X1 160 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 MTCH2Q9Y6C9 303 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 LHCGRP22888 699 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 OPRD1P41143 372 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 ADGRE1Q14246 886 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 CRTC1Q6UUV9 634 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM207Q6UWW9 146 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 LPGAT1Q92604 370 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 C20orf27Q9GZN8 174 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 CLDND1Q9NY35 253 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 DEC1Q9P2X7 70 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 MED16Q9Y2X0 877 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 VWA7Q9Y334 891 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 KLF11O14901 512 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 CLGNO14967 610 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 BIRC5O15392 142 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 LEFTY1O75610 366 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 ALDH3A1P30838 453 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 LIG3P49916 1009 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 KDSRQ06136 332 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 RUNX3Q13761 415 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 GRIN2CQ14957 1233 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 LRRC73Q5JTD7 316 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 GDPD4Q6W3E5 623 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 PIM3Q86V86 326 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 KLHL32Q96NJ5 620 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 LMCD1Q9NZU5 365 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 COPG2Q9UBF2 871 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 TLK1Q9UKI8 766 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 HCN2Q9UL51 889 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 ACOT9Q9Y305 439 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 G3V2L1 256 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 ARNTLO00327 626 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 ASLP04424 464 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 PSMC3P17980 439 aa9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms