RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 SMTNL1A8MU46 457 aa12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 J3QKU1 62 aa12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 TNFRSF10CO14798 259 aa12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 PRPSAP2O60256 369 aa12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 PRAMEF10O60809 474 aa12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 JMJD7P0C870 316 aa12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 CR2P20023 1033 aa12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 TRAF2Q12933 501 aa12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 LBRQ14739 615 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 ACOX1Q15067 660 aa12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 SMTNL2Q2TAL5 461 aa12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 LUZP1Q86V48 1076 aa12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 HEATR4Q86WZ0 1026 aa12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 NRROSQ86YC3 692 aa12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 PAF1Q8N7H5 531 aa12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 RNF214Q8ND24 703 aa12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 OR6C4Q8NGE1 309 aa12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 FNIP1Q8TF40 1166 aa12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 SPOCK2Q92563 424 aa12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 ZNF653Q96CK0 615 aa12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 NUS1Q96E22 293 aa12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 MED8Q96G25 268 aa12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 TMEM74Q96NL1 305 aa12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 RBSNQ9H1K0 784 aa12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 SEMA6CQ9H3T2 930 aa12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 DPEP2Q9H4A9 486 aa12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 HAUS4Q9H6D7 363 aa12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 RDH14Q9HBH5 336 aa12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 LRIT1Q9P2V4 623 aa12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 SEPT3Q9UH03 358 aa12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 MOSPD1Q9UJG1 213 aa12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 MYO6Q9UM54 1294 aa12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 ST14Q9Y5Y6 855 aa12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 B8ZZF3 427 aa12.11□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 RNF8O76064 485 aa12.11□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 CPP00450 1065 aa12.11□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 FTLP02792 175 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 CEACAM5P06731 702 aa12.11□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 CCDC172P0C7W6 258 aa12.11□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 WT1P19544 449 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 KELP23276 732 aa12.11□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 ETV3P41162 512 aa12.11□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 MAXP61244 160 aa12.11□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 C16orf72Q14CZ0 275 aa12.11□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 ASIC2Q16515 512 aa12.11□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 LINC00303Q3SY05 128 aa12.11□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 DENND2CQ68D51 928 aa12.11□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa12.11□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa12.11□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 TSPAN33Q86UF1 283 aa12.11□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 VASH2Q86V25 355 aa12.11□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 ZFAND4Q86XD8 727 aa12.11□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 EXD3Q8N9H8 876 aa12.11□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 GPBAR1Q8TDU6 330 aa12.11□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 PATE1Q8WXA2 126 aa12.11□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 SMIM14Q96QK8 99 aa12.11□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 MGME1Q9BQP7 344 aa12.11□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 NOD2Q9HC29 1040 aa12.11□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 A0A1B0GTH6 734 aa12.1□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 CAPN8A6NHC0 703 aa12.1□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 C9orf172C9J069 976 aa12.1□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa12.1□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 NVLO15381 856 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 B4GAT1O43505 415 aa12.1□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 MAFKO60675 156 aa12.1□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 SOCS5O75159 536 aa12.1□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 SOD1P00441 154 aa12.1□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 LIPCP11150 499 aa12.1□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 CCNB1P14635 433 aa12.1□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 PNLIPP16233 465 aa12.1□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 AMPD1P23109 780 aa12.1□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 AK4P27144 223 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 VIPR1P32241 457 aa12.1□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 PRKCIP41743 596 aa12.1□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 HCAR3P49019 387 aa12.1□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 OR1D5P58170 312 aa12.1□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 CDK3Q00526 305 aa12.1□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 B4GALNT1Q00973 533 aa12.1□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 ARHGEF7Q14155 803 aa12.1□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 ZNF235Q14590 738 aa12.1□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 DPYSL2Q16555 572 aa12.1□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 MAP9Q49MG5 647 aa12.1□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 PHF19Q5T6S3 580 aa12.1□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa12.1□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 RFLNAQ6ZTI6 216 aa12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms