RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570484.1

CTDNEP1-204, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTDNEP1, Length 393 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-204ENST00000570484 PRAMEP78395 509 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 CRADDP78560 199 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 TRADDQ15628 312 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 UGP2Q16851 508 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 LRRC73Q5JTD7 316 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 PCID2Q5JVF3 399 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 FNBP1LQ5T0N5 605 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 RANBP10Q6VN20 620 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 CAPN12Q6ZSI9 719 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 ZNF534Q76KX8 674 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 TMC3Q7Z5M5 1100 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 TMPRSS6Q8IU80 811 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 ANKMY2Q8IV38 441 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 PALM2Q8IXS6 379 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 DEPDC4Q8N2C3 294 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 SPEM1Q8N4L4 309 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 HDDC3Q8N4P3 179 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 CDKL2Q92772 493 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 ARRDC3Q96B67 414 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 ECHDC3Q96DC8 303 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 RANBP9Q96S59 729 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 HDAC8Q9BY41 377 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 NEUROG2Q9H2A3 272 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 ARNT2Q9HBZ2 717 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 ARFGAP3Q9NP61 516 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 PCDH12Q9NPG4 1184 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 RAD18Q9NS91 495 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 FBXL12Q9NXK8 326 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 PKD2L2Q9NZM6 624 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 B4GALT6Q9UBX8 382 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 RAB21Q9UL25 225 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 HCN2Q9UL51 889 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 FZD4Q9ULV1 537 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 TCAF1Q9Y4C2 921 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa6.6□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 MAGEB16A2A368 324 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 PRR23AA6NEV1 266 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 ANTXRLA6NF34 631 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 LRRC72A6NJI9 287 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 SHISA7A6NL88 538 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 E7ESA3 106 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 SLC7A4O43246 635 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 LAMTOR5O43504 91 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 ZNF217O75362 1048 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 BANF1O75531 89 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 USP1O94782 785 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 PCDH8O95206 1070 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 ACSL3O95573 720 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 IVLP07476 585 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 MYBL2P10244 700 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 GABRG2P18507 467 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 AOC1P19801 751 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 LPOP22079 712 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 HNF1BP35680 557 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 MMP12P39900 470 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 HADHAP40939 763 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 MAGEA3P43357 314 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 IFFO1Q0D2I5 559 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 CNTN1Q12860 1018 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 MTAPQ13126 283 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 CRYMQ14894 314 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 ACOX1Q15067 660 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 SKIDA1Q1XH10 827 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 ZNF284Q2VY69 593 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 SPANXN3Q5MJ09 141 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 CERCAMQ5T4B2 595 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 AGBL4Q5VU57 503 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 LRRC66Q68CR7 880 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 PKN3Q6P5Z2 889 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 AFTPHQ6ULP2 937 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 USP30Q70CQ3 517 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 DPPA4Q7L190 304 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 FAM124AQ86V42 546 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 RASSF3Q86WH2 238 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 ZSWIM9Q86XI8 627 aa6.59□□□□□ -1.35
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