RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491569.5

ATP6AP1-209, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene ATP6AP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1-209ENST00000491569 DNAJC3Q13217 504 aa20.59■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 POM121L1PQ3SYA9 428 aa20.59■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 TUBB8Q3ZCM7 444 aa20.59■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa20.59■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 SGSM3Q96HU1 749 aa20.59■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 FAM111AQ96PZ2 611 aa20.59■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 GPR22Q99680 433 aa20.59■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 HEPHQ9BQS7 1158 aa20.59■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 HACD3Q9P035 362 aa20.59■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 CD207Q9UJ71 328 aa20.59■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 SLC8A2Q9UPR5 921 aa20.59■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 WASF2Q9Y6W5 498 aa20.59■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa20.58■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 WASH3PC4AMC7 463 aa20.58■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 CLDN7O95471 211 aa20.58■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 CD151P48509 253 aa20.58■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 SLC18A1P54219 525 aa20.58■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 UGP2Q16851 508 aa20.58■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 GDPD4Q6W3E5 623 aa20.58■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 TSPAN33Q86UF1 283 aa20.58■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 SUSD6Q92537 303 aa20.58■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 ERLEC1Q96DZ1 483 aa20.58■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 VPS11Q9H270 941 aa20.58■□□□□ 0.89
ATP6AP1-209ENST00000491569 TMEM265A0A087WTH1 108 aa20.58■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 ARNTLO00327 626 aa20.58■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 ZWINTO95229 277 aa20.58■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 HHATQ5VTY9 493 aa20.58■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 PLPP6Q8IY26 295 aa20.58■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 GPATCH11Q8N954 259 aa20.58■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 NDNQ99608 321 aa20.58■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 FAM107BQ9H098 131 aa20.58■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 FAM96AQ9H5X1 160 aa20.58■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 CATSPERZQ9NTU4 200 aa20.58■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 IL17CQ9P0M4 197 aa20.58■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 WDR91A4D1P6 747 aa20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 CAPN8A6NHC0 703 aa20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 GOLGA8CPA6NN73 597 aa20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 S1PR4O95977 384 aa20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 SERPINB8P50452 374 aa20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 HTR4Q13639 388 aa20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 USP10Q14694 798 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 CDKN3Q16667 212 aa20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 KIAA0408Q6ZU52 694 aa20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 SPOCK2Q92563 424 aa20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 NECTIN4Q96NY8 510 aa20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 BRD9Q9H8M2 597 aa20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 EPS15L1Q9UBC2 864 aa20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 PHTF1Q9UMS5 762 aa20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 GRXCR2A6NFK2 248 aa20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 TM9SF1O15321 606 aa20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 GPR39O43194 453 aa20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 HMGCLP35914 325 aa20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 ZNF234Q14588 700 aa20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 ZNF460Q14592 562 aa20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 C16orf46Q6P387 395 aa20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 MTSS1LQ765P7 747 aa20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 CKAP2Q8WWK9 683 aa20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 ISL2Q96A47 359 aa20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 ELMO2Q96JJ3 720 aa20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 EPN3Q9H201 632 aa20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 ZNF358Q9NW07 568 aa20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 IL36AQ9UHA7 158 aa20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 CRYL1Q9Y2S2 319 aa20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 PLLPQ9Y342 182 aa20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 PKP3Q9Y446 797 aa20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 DENND4AQ7Z401 1863 aa20.57■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 A0A1W2PPC1 479 aa20.56■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 KAT7O95251 611 aa20.56■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 KCNA5P22460 613 aa20.56■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 PSMA3P25788 255 aa20.56■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 MC4RP32245 332 aa20.56■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 FOXN2P32314 431 aa20.56■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 MAGEA12P43365 314 aa20.56■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 CCT5P48643 541 aa20.56■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 VASPP50552 380 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 IRF9Q00978 393 aa20.56■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 PEX6Q13608 980 aa20.56■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 MRNIPQ6NTE8 343 aa20.56■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 AFTPHQ6ULP2 937 aa20.56■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 CRTC1Q6UUV9 634 aa20.56■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 ACMSDQ8TDX5 336 aa20.56■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 HCN2Q9UL51 889 aa20.56■□□□□ 0.88
ATP6AP1-209ENST00000491569 A0A096LPK6 155 aa20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms