RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 CAPN8A6NHC0 703 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD66B4E2M5 251 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 FTH1P19P0C7X4 201 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 GIMD1P0DJR0 217 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 NFKB1P19838 968 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 RBL1P28749 1068 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 TRIM23P36406 574 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP20.96■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 CDKN3Q16667 212 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 MACC1Q6ZN28 852 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 Q6ZVL8 140 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 SLCO6A1Q86UG4 719 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 NUS1Q96E22 293 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 FAM118BQ9BPY3 351 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 TOR4AQ9NXH8 423 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 KCTD5Q9NXV2 234 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-211ENST00000480301 K7ESM1 405 aa20.95■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 TNFSF14O43557 240 aa20.95■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 C1SP09871 688 aa20.95■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 ZNF30P17039 623 aa20.95■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 JUNDP17535 347 aa20.95■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 CDK18Q07002 472 aa20.95■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 NFATC4Q14934 902 aa20.95■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 PNCKQ6P2M8 343 aa20.95■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 RFLNAQ6ZTI6 216 aa20.95■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 NYAP1Q6ZVC0 841 aa20.95■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 PID1Q7Z2X4 250 aa20.95■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 KDELC2Q7Z4H8 507 aa20.95■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa20.95■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 ADGRE3Q9BY15 652 aa20.95■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 FTSJ1Q9UET6 329 aa20.95■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 DNPEPQ9ULA0 475 aa20.95■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 WASF3Q9UPY6 502 aa20.95■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 TRIM38O00635 465 aa20.94■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 NRDCO43847 1150 aa20.94■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 CLDN7O95471 211 aa20.94■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 RBP3P10745 1247 aa20.94■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 GALNT3Q14435 633 aa20.94■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 PCSK7Q16549 785 aa20.94■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 ENPP7Q6UWV6 458 aa20.94■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 PHACTR4Q8IZ21 702 aa20.94■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 RBFAQ8N0V3 343 aa20.94■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 FCRL5Q96RD9 977 aa20.94■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 UBP1Q9NZI7 540 aa20.94■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 FAM153AQ9UHL3 310 aa20.94■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 TRHDEQ9UKU6 1024 aa20.94■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa20.94■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 H3BM21 787 aa20.93■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 DKK1O94907 266 aa20.93■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 HTR1BP28222 390 aa20.93■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 STC1P52823 247 aa20.93■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 KIAA1024LP59773 190 aa20.93■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 FOXC1Q12948 553 aa20.93■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 MEI1Q5TIA1 1274 aa20.93■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 KDELC1Q6UW63 502 aa20.93■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 PNPLA1Q8N8W4 532 aa20.93■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 OR4C6Q8NH72 309 aa20.93■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 BTN2A2Q8WVV5 523 aa20.93■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 LGR4Q9BXB1 951 aa20.93■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 ABCG8Q9H221 673 aa20.93■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 USP29Q9HBJ7 922 aa20.93■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 CD84Q9UIB8 345 aa20.93■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa20.92■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa20.92■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 F5H423 210 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 ENC1O14682 589 aa20.92■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 SCAMP1O15126 338 aa20.92■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 SIGLEC6O43699 453 aa20.92■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 PMPCBO75439 489 aa20.92■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 TRIM16O95361 564 aa20.92■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 PPARDQ03181 441 aa20.92■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 DPTQ07507 201 aa20.92■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 ALG11Q2TAA5 492 aa20.92■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 KCTD16Q68DU8 428 aa20.92■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 NLRP8Q86W28 1048 aa20.92■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 TTC13Q8NBP0 860 aa20.92■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 LMX1AQ8TE12 382 aa20.92■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 SCAMP4Q969E2 229 aa20.92■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 WDR92Q96MX6 357 aa20.92■□□□□ 0.94
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