RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 CLDN7O95471 211 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 SOD1P00441 154 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 TRBC1P01850 177 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 CSF2P04141 144 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 PIRTP0C851 137 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 MX2P20592 715 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 XPAP23025 273 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 VIPR1P32241 457 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM23P36406 574 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 GRK6P43250 576 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 RABIFP47224 123 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 OLIG2Q13516 323 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC14Q15048 493 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 NOMO1Q15155 1222 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 QPCTQ16769 361 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 ALG11Q2TAA5 492 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 TEX44Q53QW1 395 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC45A4Q5BKX6 768 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 TFDP3Q5H9I0 405 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 ARMC12Q5T9G4 340 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 DENND2CQ68D51 928 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 ENPP7Q6UWV6 458 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 Q6ZVL8 140 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 KDELC2Q7Z4H8 507 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 KIAA1328Q86T90 577 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 PACS2Q86VP3 889 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 RCOR2Q8IZ40 523 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 EXD1Q8NHP7 514 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 NSMCE1Q8WV22 266 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 SCRN2Q96FV2 425 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIB3Q96RU7 358 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 GLOD4Q9HC38 313 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 DNAJC28Q9NX36 388 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 SEPT10Q9P0V9 454 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 CD84Q9UIB8 345 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 TTLL3Q9Y4R7 772 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 ST14Q9Y5Y6 855 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 FREM2Q5SZK8 3169 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 LAMA5O15230 3695 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 CFAP69A5D8W1 941 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM149AA5PLN7 773 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 AURKAO14965 403 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 FFAR2O15552 330 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 TNFSF14O43557 240 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 MAGEC1O60732 1142 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 CAPNS1P04632 268 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 ELFN1P0C7U0 828 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 C1QTNF9P0C862 333 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 NME1P15531 152 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 JUNDP17535 347 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 TGM2P21980 687 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 RBL1P28749 1068 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 CA5AP35218 305 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 ETV3P41162 512 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 ACADVLP49748 655 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 SUOXP51687 545 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 STC1P52823 247 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 SHC2P98077 582 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 FOXK2Q01167 660 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 GALNT3Q14435 633 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 ACOX1Q15067 660 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 PDK1Q15118 436 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP2R5EQ16537 467 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC157Q569K6 752 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 RALGPS1Q5JS13 557 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 CFAP58Q5T655 872 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC66Q68CR7 880 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 ERAP2Q6P179 960 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 PNCKQ6P2M8 343 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 KDELC1Q6UW63 502 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 DHRS13Q6UX07 377 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 BBS12Q6ZW61 710 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC50Q8IVM0 306 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC8AQ8IWT6 810 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF567Q8N184 647 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 BBS5Q8N3I7 341 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 OXR1Q8N573 874 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 CCL4L1Q8NHW4 92 aa7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms