RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 NLRP9Q7RTR0 991 aa27.8■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 TMC3Q7Z5M5 1100 aa27.8■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 TTC30BQ8N4P2 665 aa27.8■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP27.8■■■□□ 2.042e-9■■■■■ 44.1
GIPC1-201ENST00000345425 SIGLEC10Q96LC7 697 aa27.8■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 ARL5AQ9Y689 179 aa27.8■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa27.79■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 FAM47DPA6NHR8 397 aa27.79■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 AURKAO14965 403 aa27.79■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 LPOP22079 712 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 FNTBP49356 437 aa27.79■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 RPS21P63220 83 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
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GIPC1-201ENST00000345425 CCDC38Q502W7 563 aa27.79■■■□□ 2.04
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GIPC1-201ENST00000345425 PKP3Q9Y446 797 aa27.79■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa27.79■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 A0A0U1RQS6 177 aa27.78■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 LDB2O43679 373 aa27.78■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 STC1P52823 247 aa27.78■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC25Q86WR0 208 aa27.78■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 MPP5Q8N3R9 675 aa27.78■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 NAT9Q9BTE0 207 aa27.78■■■□□ 2.04
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GIPC1-201ENST00000345425 NUMA1Q14980 2115 aa27.78■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 PRR23AA6NEV1 266 aa27.78■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 MROH6A6NGR9 719 aa27.78■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 MMP20O60882 483 aa27.78■■■□□ 2.04
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GIPC1-201ENST00000345425 C6P13671 934 aa27.78■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF528Q3MIS6 628 aa27.78■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 SLC36A4Q6YBV0 504 aa27.78■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 CCNJLQ8IV13 435 aa27.78■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 PEX13Q92968 403 aa27.78■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa27.78■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 C19orf43Q9BQ61 176 aa27.78■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 KIFC1Q9BW19 673 aa27.78■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 PKD2L2Q9NZM6 624 aa27.78■■■□□ 2.04
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GIPC1-201ENST00000345425 VSNL1P62760 191 aa27.77■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 TRIM69Q86WT6 500 aa27.77■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 HORMAD1Q86X24 394 aa27.77■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP27.77■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 STYXQ8WUJ0 223 aa27.77■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 PARD6BQ9BYG5 372 aa27.77■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 SAYSD1Q9NPB0 183 aa27.77■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 CHRAC1Q9NRG0 131 aa27.77■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 IL17CQ9P0M4 197 aa27.77■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 RIMKLBQ9ULI2 386 aa27.77■■■□□ 2.04
GIPC1-201ENST00000345425 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
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GIPC1-201ENST00000345425 C1SP09871 688 aa27.76■■■□□ 2.03
GIPC1-201ENST00000345425 ACOX1Q15067 660 aa27.76■■■□□ 2.03
GIPC1-201ENST00000345425 ANGPT1Q15389 498 aa27.76■■■□□ 2.03
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GIPC1-201ENST00000345425 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
GIPC1-201ENST00000345425 MYRIPQ8NFW9 859 aa27.76■■■□□ 2.03
GIPC1-201ENST00000345425 EID2BQ96D98 161 aa27.76■■■□□ 2.03
GIPC1-201ENST00000345425 GPR174Q9BXC1 333 aa27.76■■■□□ 2.03
GIPC1-201ENST00000345425 RAD18Q9NS91 495 aa27.76■■■□□ 2.03
GIPC1-201ENST00000345425 KCTD5Q9NXV2 234 aa27.76■■■□□ 2.03
GIPC1-201ENST00000345425 TEX264Q9Y6I9 313 aa27.76■■■□□ 2.03
GIPC1-201ENST00000345425 EML5Q05BV3 1969 aa27.76■■■□□ 2.03
GIPC1-201ENST00000345425 A0A1W2PQU0 124 aa27.76■■■□□ 2.03
GIPC1-201ENST00000345425 ELK3P41970 407 aa27.76■■■□□ 2.03
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
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GIPC1-201ENST00000345425 PCED1AQ9H1Q7 454 aa27.76■■■□□ 2.03
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GIPC1-201ENST00000345425 TMEM259Q4ZIN3 620 aa27.75■■■□□ 2.03
GIPC1-201ENST00000345425 COQ10AQ96MF6 247 aa27.75■■■□□ 2.03
GIPC1-201ENST00000345425 CHMP2BQ9UQN3 213 aa27.75■■■□□ 2.03
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GIPC1-201ENST00000345425 KCTD3Q9Y597 815 aa27.75■■■□□ 2.03
GIPC1-201ENST00000345425 WNT9AO14904 365 aa27.74■■■□□ 2.03
GIPC1-201ENST00000345425 SPINT3P49223 89 aa27.74■■■□□ 2.03
GIPC1-201ENST00000345425 CREB5Q02930 508 aa27.74■■■□□ 2.03
GIPC1-201ENST00000345425 SGCGQ13326 291 aa27.74■■■□□ 2.03
GIPC1-201ENST00000345425 SEL1L3Q68CR1 1132 aa27.74■■■□□ 2.03
GIPC1-201ENST00000345425 CYP2U1Q7Z449 544 aa27.74■■■□□ 2.03
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