RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	MEIOB	Q8N635	442 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	OR10G6	Q8NH81	332 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	CXorf38	Q8TB03	319 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	KCNN1	Q92952	543 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	PLD4	Q96BZ4	506 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	GPR137	Q96N19	417 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	LRFN5	Q96NI6	719 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	GBP5	Q96PP8	586 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	OR6C1	Q96RD1	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	SMO	Q99835	787 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF747	Q9BV97	191 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	SCML2	Q9UQR0	700 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	LINC01387	J3KSC0	135 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	OGT	O15294	1046 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	THAP12	O43422	761 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	ATP9B	O43861	1147 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	TSPAN12	O95859	305 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	FGF1	P05230	155 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	CTSL	P07711	333 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	ITGA2	P17301	1181 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	HTR1B	P28222	390 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	SGCG	Q13326	291 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	SQLE	Q14534	574 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	NFATC4	Q14934	902 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	ZACN	Q401N2	412 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	MFN1	Q8IWA4	741 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	TMIE	Q8NEW7	156 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	PERP	Q96FX8	193 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	PDXP	Q96GD0	296 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	AGAP4	Q96P64	663 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	KCNK16	Q96T55	309 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	DCTPP1	Q9H773	170 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	KL	Q9UEF7	1012 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772		A0A1W2PPR1	153 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	ECEL1	O95672	775 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	TNF	P01375	233 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	C9	P02748	559 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	CAPN1	P07384	714 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	PVR	P15151	417 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	NNMT	P40261	264 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	HADHA	P40939	763 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	TNFSF10	P50591	281 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	SGSH	P51688	502 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	PDE1B	Q01064	536 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	APBA1	Q02410	837 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	IHH	Q14623	411 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	TCEA2	Q15560	299 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	ADGRF1	Q5T601	910 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	TTC22	Q5TAA0	569 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	KAZN	Q674X7	775 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	KCTD16	Q68DU8	428 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62

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