RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580515.5

TSPOAP1-AS1-206, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 980 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SLC35F3Q8IY50 421 aa24.18■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MAPK15Q8TD08 544 aa24.18■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 FAF2Q96CS3 445 aa24.18■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 COQ10AQ96MF6 247 aa24.18■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 DGKBQ9Y6T7 804 aa24.18■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 KNTC1P50748 2209 aa24.18■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CTSEP14091 401 aa24.17■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 VIPR1P32241 457 aa24.17■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ACOX1Q15067 660 aa24.17■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CNGA3Q16281 694 aa24.17■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NYAP1Q6ZVC0 841 aa24.17■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TPCN2Q8NHX9 752 aa24.17■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MAML1Q92585 1016 aa24.17■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 FATE1Q969F0 183 aa24.17■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TSGA13Q96PP4 275 aa24.17■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NT5MQ9NPB1 228 aa24.17■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 KCTD5Q9NXV2 234 aa24.17■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MYLKQ15746 1914 aa24.16■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MATN3O15232 486 aa24.16■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MFAP3LO75121 409 aa24.16■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PGLSO95336 258 aa24.16■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TGM2P21980 687 aa24.16■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CCNCP24863 283 aa24.16■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ALG1LQ6GMV1 187 aa24.16■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PNCKQ6P2M8 343 aa24.16■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 RD3Q7Z3Z2 195 aa24.16■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 OR56A4Q8NGH8 313 aa24.16■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NAT6Q93015 286 aa24.16■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SCRN2Q96FV2 425 aa24.16■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP24.16■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CHP1Q99653 195 aa24.16■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 DOLKQ9UPQ8 538 aa24.16■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PPIL1Q9Y3C6 166 aa24.16■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa24.16■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 FAM208BQ5VWN6 2430 aa24.16■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ACACAQ13085 2346 aa24.15■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TMEM202A6NGA9 273 aa24.15■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TNFRSF10CO14798 259 aa24.15■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TNFP01375 233 aa24.15■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 KELP23276 732 aa24.15■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 COL28A1Q2UY09 1125 aa24.15■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PERM1Q5SV97 790 aa24.15■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ARMC12Q5T9G4 340 aa24.15■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 KCTD16Q68DU8 428 aa24.15■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 GKN2Q86XP6 184 aa24.15■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PQLC3Q8N755 202 aa24.15■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ARL10Q8N8L6 244 aa24.15■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 RNF214Q8ND24 703 aa24.15■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SLC35G2Q8TBE7 412 aa24.15■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 OR1E3Q8WZA6 343 aa24.15■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NUS1Q96E22 293 aa24.15■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PDXPQ96GD0 296 aa24.15■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CCDC42Q96M95 316 aa24.15■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SEMA3CQ99985 751 aa24.15■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 AMACRQ9UHK6 382 aa24.15■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PADI4Q9UM07 663 aa24.15■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 RAI2Q9Y5P3 530 aa24.15■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NBEAQ8NFP9 2946 aa24.15■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PSMD11O00231 422 aa24.14■■□□□ 1.45
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 FZD6O60353 706 aa24.14■■□□□ 1.45
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 BRINP1O60477 761 aa24.14■■□□□ 1.45
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CSO75390 466 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 LHCGRP22888 699 aa24.14■■□□□ 1.45
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CES1P23141 567 aa24.14■■□□□ 1.45
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MESDQ14696 234 aa24.14■■□□□ 1.45
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PELI3Q8N2H9 469 aa24.14■■□□□ 1.45
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PIH1D2Q8WWB5 315 aa24.14■■□□□ 1.45
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 LGR4Q9BXB1 951 aa24.14■■□□□ 1.45
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 WDR26Q9H7D7 661 aa24.14■■□□□ 1.45
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 FGF22Q9HCT0 170 aa24.14■■□□□ 1.45
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MTA2O94776 668 aa24.13■■□□□ 1.45
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MAP3K6O95382 1288 aa24.13■■□□□ 1.45
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 KDELR1P24390 212 aa24.13■■□□□ 1.45
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ARHGAP25P42331 645 aa24.13■■□□□ 1.45
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 GBE1Q04446 702 aa24.13■■□□□ 1.45
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ITKQ08881 620 aa24.13■■□□□ 1.45
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 USP45Q70EL2 814 aa24.13■■□□□ 1.45
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 RAPGEF5Q92565 580 aa24.13■■□□□ 1.45
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 DTD2Q96FN9 168 aa24.13■■□□□ 1.45
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SPTLC3Q9NUV7 552 aa24.13■■□□□ 1.45
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 LRP4O75096 1905 aa24.13■■□□□ 1.45
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ADAMTS20P59510 1910 aa24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms