RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TULP2O00295 520 aa4.57□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TNFSF14O43557 240 aa4.57□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KDM4BO94953 1096 aa4.57□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PMS2P2O95744 297 aa4.57□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ABCD3P28288 659 aa4.57□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GABRB2P47870 512 aa4.57□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM69AQ5T7M9 428 aa4.57□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HEATR4Q86WZ0 1026 aa4.57□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EXOC8Q8IYI6 725 aa4.57□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPATA22Q8NHS9 363 aa4.57□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KLHL29Q96CT2 875 aa4.57□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HAUS8Q9BT25 410 aa4.57□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 H2AFJQ9BTM1 129 aa4.57□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BRF2Q9HAW0 419 aa4.57□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa4.57□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MALT1Q9UDY8 824 aa4.57□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PGAP2Q9UHJ9 254 aa4.57□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SARDHQ9UL12 918 aa4.57□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SCINQ9Y6U3 715 aa4.57□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SOCS6O14544 535 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SEC14L5O43304 696 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DDNO94850 711 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CYC1P08574 325 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LINC00271P0C7V0 271 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IRF1P10914 325 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SRCP12931 536 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 XBP1P17861 261 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 STX2P32856 288 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM76BQ5HYJ3 339 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WBP2NLQ6ICG8 309 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CUZD1Q86UP6 607 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NFKBIDQ8NI38 313 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPM1EQ8WY54 764 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RND1Q92730 232 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MTBPQ96DY7 904 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIF1BPQ96EK5 621 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IL17FQ96PD4 163 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR1F2PQ96R84 312 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RETREG1Q9H6L5 497 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BPIFA1Q9NP55 256 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TINAGQ9UJW2 476 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A1B0GVC2 190 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM202A6NGA9 273 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF587BE7ETH6 402 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MID1O15344 667 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAOAP21397 527 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ABCD1P33897 745 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PAFAH1B1P43034 410 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DLX5P56178 289 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LCTLQ6UWM7 567 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NR2C2APQ86WQ0 139 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RFLNBQ8N5W9 214 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZBTB2Q8N680 514 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HUS1BQ8NHY5 278 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SORCS1Q8WY21 1168 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TANKQ92844 425 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C3orf30Q96M34 536 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TBATAQ96M53 351 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 USP44Q9H0E7 712 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC25A18Q9H1K4 315 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C17orf75Q9HAS0 396 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VEZTQ9HBM0 779 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CNGB3Q9NQW8 809 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF224Q9NZL3 707 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C1RLQ9NZP8 487 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RCOR1Q9UKL0 485 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UTYO14607 1347 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A6NLC8 198 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRAC2D3DTV9 90 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RFPL2O75678 378 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 G6PDP11413 515 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CPOXP36551 454 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GNAQP50148 359 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RAD23BP54727 409 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ALG11Q2TAA5 492 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF718Q3SXZ3 478 aa4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms