RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356435.9

PTPRD-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 9,472 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-202ENST00000356435 VARSP26640 1264 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 IL12BP29460 328 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 DMPKQ09013 629 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 KCNMA1Q12791 1236 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 TROAPQ12815 778 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 GPR158Q5T848 1215 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 TAF8Q7Z7C8 310 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 HEATR4Q86WZ0 1026 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 SLAIN1Q8ND83 568 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 CAPSLQ8WWF8 208 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 PPCDCQ96CD2 204 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 AIF1LQ9BQI0 150 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 DEC1Q9P2X7 70 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 TPP1O14773 563 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 CLOCKO15516 846 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 HGFP14210 728 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 LRPAP1P30533 357 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 BEND5Q7L4P6 421 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 SNX20Q7Z614 316 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 ANKRD23Q86SG2 305 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 KATNAL2Q8IYT4 538 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 GJD3Q8N144 294 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 KBTBD8Q8NFY9 601 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 COQ7Q99807 217 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 IRAK3Q9Y616 596 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 SLC5A9Q2M3M2 681 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 DAW1Q8N136 415 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 AKAP3O75969 853 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 CCDC166P0CW27 439 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 CCNB1P14635 433 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 SP2Q02086 613 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 LAPTM5Q13571 262 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 PPP2R2DQ66LE6 453 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 CHST9Q7L1S5 443 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 PJA1Q8NG27 643 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 RDH11Q8TC12 318 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 SEMA4DQ92854 862 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 TNFRSF25Q93038 417 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 AP2M1Q96CW1 435 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 PLEKHA1Q9HB21 404 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 MCCC2Q9HCC0 563 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 CIDEBQ9UHD4 219 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 FAM92AA1XBS5 289 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 WASHC1A8K0Z3 465 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 WASH3PC4AMC7 463 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 CLDN4O14493 209 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 UNC5CO95185 931 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 PGK1P00558 417 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 CYP3A4P08684 503 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 ITPKBP27987 946 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 CD52P31358 61 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 RPIAP49247 311 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 SLC7A2P52569 658 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 CHN2P52757 468 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 RPL38P63173 70 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 WASH2PQ6VEQ5 465 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 LPCAT2Q7L5N7 544 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 STK32CQ86UX6 486 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 OR5T3Q8NGG3 340 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 MTMR8Q96EF0 704 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 VPS35Q96QK1 796 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 MYOCQ99972 504 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 BPIFA1Q9NP55 256 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 TMEM138Q9NPI0 162 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 MORF4L1Q9UBU8 362 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 DAPK2Q9UIK4 370 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 ERVK-11Q9UQG0 969 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 MYRFQ9Y2G1 1151 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 KCNE2Q9Y6J6 123 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 TRIM64A6NGJ6 449 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 KMOO15229 486 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 CCL16O15467 120 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 CHP2O43745 196 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 OR10H3O60404 316 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 CCKBRP32239 447 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-202ENST00000356435 SSR2P43308 183 aa5.55□□□□□ -1.52
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