RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299162.9

FOXN4-201, Transcript of forkhead box N4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN4, Length 3,350 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN4-201ENST00000299162 OLFM1Q99784 485 aa10.15□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 FAM96AQ9H5X1 160 aa10.15□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 MUSKO15146 869 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 GRK2P25098 689 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 RENBPP51606 427 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 MAPK10P53779 464 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 RAB10P61026 200 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 SLC12A1Q13621 1099 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 NADK2Q4G0N4 442 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 SLC44A4Q53GD3 710 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 CLEC6AQ6EIG7 209 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 FUT10Q6P4F1 479 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 SLC45A3Q96JT2 553 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 FCRL5Q96RD9 977 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 CDH19Q9H159 772 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 RGS18Q9NS28 235 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 PLK2Q9NYY3 685 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 MYO9BQ13459 2157 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 PAMP19021 973 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TFEBP19484 476 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 C16orf72Q14CZ0 275 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 GSTA3Q16772 222 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 SEL1L3Q68CR1 1132 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 KLHDC10Q6PID8 442 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 ZNF554Q86TJ5 538 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 ESAMQ96AP7 390 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 CAPNS2Q96L46 248 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TUBB6Q9BUF5 446 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 KIFC1Q9BW19 673 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 FBXO44Q9H4M3 255 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 GIMAP2Q9UG22 337 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 SRRDQ9UH36 339 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 A0A1W2PQ67 120 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 MAGEB16A2A368 324 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 MTMR11A4FU01 709 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 LRRC14BA6NHZ5 514 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 SUPT7LO94864 414 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 MPOP05164 745 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 PCSK6P29122 969 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 C6orf52Q5T4I8 152 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 UTS2BQ765I0 119 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 PGBD5Q8N414 524 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 ANKRD49Q8WVL7 239 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 IL12RB2Q99665 862 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 GPR22Q99680 433 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 DTNAQ9Y4J8 743 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa10.14□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 A0A1B0GTW7 788 aa10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 H3BSA7 217 aa10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 ENPP3O14638 875 aa10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 IGLV3-25P01717 112 aa10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 BMP1P13497 986 aa10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 CHN2P52757 468 aa10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 HPCAP84074 193 aa10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 DMPKQ09013 629 aa10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 KRT72Q14CN4 511 aa10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 NRF1Q16656 503 aa10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TCTN1Q2MV58 587 aa10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 SIRPB2Q5JXA9 342 aa10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 AMIGO2Q86SJ2 522 aa10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TRIML2Q8N7C3 387 aa10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TLR6Q9Y2C9 796 aa10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 CEP290O15078 2479 aa10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TM7SF2O76062 418 aa10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 UQCRBP14927 111 aa10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TYMPP19971 482 aa10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 FGFR3P22607 806 aa10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 CYP2C18P33260 490 aa10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TRPC1P48995 793 aa10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 PLD1Q13393 1074 aa10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 FBXL19Q6PCT2 694 aa10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 UROC1Q96N76 676 aa10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 DEFB118Q96PH6 123 aa10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TLE6Q9H808 572 aa10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 IL1RL2Q9HB29 575 aa10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms