RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641901.1

SAMMSON-222, survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA, human

BASIC

Gene SAMMSON, Length 2,727 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SAMMSON-222	ENST00000641901		A0A087X1B8	175 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	SLC12A8	A0AV02	714 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901		A6NHS1	94 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	CCDC166	P0CW27	439 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	SLC2A3	P11169	496 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	PRDX6	P30041	224 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	POLD2	P49005	469 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	POU4F1	Q01851	419 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	KLC1	Q07866	573 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	LCA5	Q86VQ0	697 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	KDM1B	Q8NB78	822 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	HDAC10	Q969S8	669 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	7.53	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	CDYL	Q9Y232	598 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		7.52	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	DPPA5	A6NC42	116 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	MUSK	O15146	869 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	FKBP6	O75344	327 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	VNN2	O95498	520 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	PRKAA2	P54646	552 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	FAM189B	P81408	668 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	ACAD11	Q709F0	780 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	ABI1	Q8IZP0	508 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	SPDL1	Q96EA4	605 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	IL37	Q9NZH6	218 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	MROH6	A6NGR9	719 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901		A8MT66	165 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	RAMP2	O60895	175 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	PIRT	P0C851	137 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	THRA	P10827	490 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	DNAJB1	P25685	340 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	OR1E1	P30953	314 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	MTTP	P55157	894 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	CDKN2D	P55273	166 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	DEFB103A	P81534	67 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	ASPH	Q12797	758 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	LPCAT4	Q643R3	524 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	PIM3	Q86V86	326 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	TEX26	Q8N6G2	289 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	GIPC2	Q8TF65	315 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	RCN3	Q96D15	328 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	PHF21B	Q96EK2	531 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	CNDP1	Q96KN2	507 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	VPS45	Q9NRW7	570 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	FNIP2	Q9P278	1114 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SAMMSON-222	ENST00000641901	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		7.52	□□□□□ -1.21

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