RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	ADAM10	O14672	748 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	MAP3K7	O43318	606 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	RASAL1	O95294	804 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	LYPLA2	O95372	231 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	TNF	P01375	233 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	HTR1B	P28222	390 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	OTX2	P32243	289 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	PNPLA4	P41247	253 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	PGF	P49763	221 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF445	P59923	1031 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	COG7	P83436	770 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	IHH	Q14623	411 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	KAZN	Q674X7	775 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440		Q6ZPA2	131 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	CD302	Q8IX05	232 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	AGAP4	Q96P64	663 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	IP6K3	Q96PC2	410 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	CCL19	Q99731	98 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	COL7A1	Q02388	2944 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNAP23-223	ENST00000627440	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC169	A6NNP5	214 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM157A	C9JC47	383 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	GABRD	O14764	452 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	ALOX15B	O15296	676 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	CLDN3	O15551	220 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	SLITRK3	O94933	977 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	SOX30	O94993	753 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	FGF5	P12034	268 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	IGFALS	P35858	605 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	SOX8	P57073	446 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	ECT2L	Q008S8	904 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	VEZF1	Q14119	521 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	OCLN	Q16625	522 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	MEIOB	Q8N635	442 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	RND1	Q92730	232 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	HDAC10	Q969S8	669 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	MAP3K3	Q99759	626 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	REG4	Q9BYZ8	158 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	GSX2	Q9BZM3	304 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	COMMD8	Q9NX08	183 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	DPP3	Q9NY33	737 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	CR1	P17927	2039 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM92A	A1XBS5	289 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	PP2D1	A8MPX8	630 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	MOCS3	O95396	460 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	ECEL1	O95672	775 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	MLYCD	O95822	493 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	STATH	P02808	62 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	TYRP1	P17643	537 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	GNA11	P29992	359 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	PTH2R	P49190	550 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	SMTN	P53814	917 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	SH3BP2	P78314	561 aa		6.26	□□□□□ -1.41

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