RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576084.5

COX11-208, Transcript of cytochrome c oxidase copper chaperone COX11, human

TSL 3

Gene COX11, Length 652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COX11-208	ENST00000576084	PPP1R3D	O95685	299 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	ADA	P00813	363 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	SERPINC1	P01008	464 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	TNNT1	P13805	278 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	ZNF12	P17014	697 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	DSCR9	P59020	149 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	TLE2	Q04725	743 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	UBE3A	Q05086	875 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	POU5F1B	Q06416	359 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	KEAP1	Q14145	624 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	ANKRD1	Q15327	319 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	ME3	Q16798	604 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	FSCB	Q5H9T9	825 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	BBS12	Q6ZW61	710 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	USP38	Q8NB14	1042 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	TMEM18	Q96B42	140 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	LHPP	Q9H008	270 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	CD93	Q9NPY3	652 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	SELENON	Q9NZV5	590 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	DHDH	Q9UQ10	334 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		3.58	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	VWA5A	O00534	786 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	STRN	O43815	780 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	TSPAN3	O60637	253 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	CBX6	O95503	412 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	GLUD1	P00367	558 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	ITGB8	P26012	769 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	CNTF	P26441	200 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	TTK	P33981	857 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	GLUD2	P49448	558 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	CENPA	P49450	140 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	CLTCL1	P53675	1640 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	BNC1	Q01954	994 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	AKAP12	Q02952	1782 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	MYBPC2	Q14324	1141 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	SLC18A3	Q16572	532 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	PDXDC1	Q6P996	788 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	NHS	Q6T4R5	1651 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	TMC8	Q8IU68	726 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	MEIS3	Q99687	375 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	REEP2	Q9BRK0	252 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	CRB1	P82279	1406 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	AGR2	O95994	175 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	POLB	P06746	335 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	MMP3	P08254	477 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	NAGA	P17050	411 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	CTPS1	P17812	591 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	PAX3	P23760	479 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	YWHAQ	P27348	245 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	AMT	P48728	403 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	CXCR3	P49682	368 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	CCR5	P51681	352 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	NUDT6	P53370	316 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	VAMP2	P63027	116 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	CHRND	Q07001	517 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	KIF5A	Q12840	1032 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	TRPC3	Q13507	836 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	EVI5L	Q96CN4	794 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	MED30	Q96HR3	178 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	3.56	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	IL25	Q9H293	177 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	TMEM160	Q9NX00	188 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	GGA3	Q9NZ52	723 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COX11-208	ENST00000576084	GDA	Q9Y2T3	454 aa		3.56	□□□□□ -1.84

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