RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 SHC3Q92529 594 aa11.99□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 ART4Q93070 314 aa11.99□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 NUDT22Q9BRQ3 303 aa11.99□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 ZPBPQ9BS86 351 aa11.99□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 GSDMCQ9BYG8 508 aa11.99□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 TMEM168Q9H0V1 697 aa11.99□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 PDCL3Q9H2J4 239 aa11.99□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 TMEM248Q9NWD8 314 aa11.99□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 MOSPD1Q9UJG1 213 aa11.99□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 KCTD3Q9Y597 815 aa11.99□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa11.99□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 UNC13CQ8NB66 2214 aa11.99□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 LRRK2Q5S007 2527 aa11.99□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 EFCAB7A8K855 629 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 MKRN2OSH3BPM6 223 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 NKX2-8O15522 239 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 MTSS1O43312 755 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 PRKAR1AP10644 381 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 CCNB1P14635 433 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 ITIH2P19823 946 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 LIG3P49916 1009 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 BPIFB4P59827 614 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 ABHD18Q0P651 414 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP11.98□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 SQSTM1Q13501 440 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 RAPGEF1Q13905 1077 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 TTI2Q6NXR4 508 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 TRIM65Q6PJ69 517 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 BRAT1Q6PJG6 821 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 NLRP14Q86W24 1093 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 FAM131BQ86XD5 332 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 FAM129CQ86XR2 697 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 DNAAF5Q86Y56 855 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 NRSN1Q8IZ57 195 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 VOPP1Q96AW1 172 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 C18orf8Q96DM3 657 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 ZMYND15Q9H091 742 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 CYP4F12Q9HCS2 524 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 FGF22Q9HCT0 170 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 PCDH12Q9NPG4 1184 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 APEX2Q9UBZ4 518 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 OR12D3Q9UGF7 316 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 DNAI1Q9UI46 699 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 RELNP78509 3460 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 TSPAN11A1L157 253 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 TMEM202A6NGA9 273 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 THRAP10827 490 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 TCN2P20062 427 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 CD1CP29017 333 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 GABRB2P47870 512 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 ARSDP51689 593 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 MAZP56270 477 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 GPLD1P80108 840 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 DEFB109BQ30KR1 87 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 ARTNQ5T4W7 220 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 MANEALQ5VSG8 457 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 TCTN3Q6NUS6 607 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 CEACAM20Q6UY09 585 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 ARCQ7LC44 396 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 BNIPLQ7Z465 357 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 KDELC2Q7Z4H8 507 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 HEATR4Q86WZ0 1026 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 SSC4DQ8WTU2 575 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 TBC1D31Q96DN5 1066 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 SUV39H2Q9H5I1 410 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 WDR26Q9H7D7 661 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 PRDM8Q9NQV8 689 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 NDFIP2Q9NV92 336 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 KCNK4Q9NYG8 393 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 PILRAQ9UKJ1 303 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 LRRK1Q38SD2 2015 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 SDK2Q58EX2 2172 aa11.96□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 PRSS38A1L453 326 aa11.96□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 DUX1O43812 170 aa11.96□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 KRT7P08729 469 aa11.96□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 TRIM23P36406 574 aa11.96□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 FLT3P36888 993 aa11.96□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 MMP12P39900 470 aa11.96□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 KLHL10Q6JEL2 608 aa11.96□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 TMEM71Q6P5X7 295 aa11.96□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 GJB7Q6PEY0 223 aa11.96□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 LEKR1Q6ZMV7 388 aa11.96□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 GBP6Q6ZN66 633 aa11.96□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 XYLT1Q86Y38 959 aa11.96□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 GALNT11Q8NCW6 608 aa11.96□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 NELFBQ8WX92 580 aa11.96□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 STARD8Q92502 1023 aa11.96□□□□□ -0.49
CS-228ENST00000551473 PMEPA1Q969W9 287 aa11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms