RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 TTC8Q8TAM2 541 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 RMDN2Q96LZ7 410 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 OMDQ99983 421 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 CIPCQ9C0C6 399 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 ABCF3Q9NUQ8 709 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 LHX3Q9UBR4 397 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 EPOPA6NHQ4 379 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 C2orf81A6NN90 581 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 GFRA2O00451 464 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 PLIN3O60664 434 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 CRTAMO95727 393 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 ITGA9Q13797 1035 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 POM121L1PQ3SYA9 428 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 PITRM1Q5JRX3 1037 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 CES4AQ5XG92 561 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 CILP2Q8IUL8 1156 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 CPXM2Q8N436 756 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 ACMSDQ8TDX5 336 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 ACDQ96AP0 544 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 GPR22Q99680 433 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 FAM167BQ9BTA0 163 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 C20orf27Q9GZN8 174 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 RETREG1Q9H6L5 497 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 SPHK2Q9NRA0 654 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 BRWD1Q9NSI6 2320 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 VCANP13611 3396 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 STX7O15400 261 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 BPGMP07738 259 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 SLC35E2BP0CK96 405 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 ALADP13716 330 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 EPHA5P54756 1037 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 ERVK-21P61565 698 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 BCL2L1Q07817 233 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 TNK2Q07912 1038 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 CSHL1Q14406 222 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 FUT11Q495W5 492 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 TCEAL5Q5H9L2 206 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 MPP7Q5T2T1 576 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 ARMC12Q5T9G4 340 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 ALG1LQ6GMV1 187 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 NCEH1Q6PIU2 408 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 ZNF783Q6ZMS7 281 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 PIM3Q86V86 326 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 FAM217AQ8IXS0 508 aa8.45□□□□□ -1.06
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CS-215ENST00000549143 CALML6Q8TD86 181 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 NXNL1Q96CM4 212 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 TSNARE1Q96NA8 513 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 GPR63Q9BZJ6 419 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 MTG2Q9H4K7 406 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 EBF3Q9H4W6 596 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 NMRAL1Q9HBL8 299 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 ACOT9Q9Y305 439 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 ZNF197O14709 1029 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 SLC7A4O43246 635 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 CPA3P15088 417 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 ALDH3A1P30838 453 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 LIG3P49916 1009 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 RAB10P61026 200 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 SEMA3AQ14563 771 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 PRSS36Q5K4E3 855 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 ZNF449Q6P9G9 518 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 Q6ZVU0 165 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 SRLQ86TD4 932 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 VN1R2Q8NFZ6 395 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 RFWD2Q8NHY2 731 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 OLFM1Q99784 485 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa8.44□□□□□ -1.06
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CS-215ENST00000549143 COPG2Q9UBF2 871 aa8.44□□□□□ -1.06
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CS-215ENST00000549143 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 TRIOO75962 3097 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 ITM2AO43736 263 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 RPP40O75818 363 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
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