RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532308.5

TSTA3-215, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 951 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-215ENST00000532308 A0A1W2PP55 124 aa20.52■□□□□ 0.88
TSTA3-215ENST00000532308 CAPN8A6NHC0 703 aa20.52■□□□□ 0.88
TSTA3-215ENST00000532308 SDR42E2A6NKP2 422 aa20.52■□□□□ 0.88
TSTA3-215ENST00000532308 CTIFO43310 598 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
TSTA3-215ENST00000532308 AVILO75366 819 aa20.52■□□□□ 0.88
TSTA3-215ENST00000532308 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
TSTA3-215ENST00000532308 APBB3O95704 486 aa20.52■□□□□ 0.88
TSTA3-215ENST00000532308 MGAT1P26572 445 aa20.52■□□□□ 0.88
TSTA3-215ENST00000532308 DRD3P35462 400 aa20.52■□□□□ 0.88
TSTA3-215ENST00000532308 P2RY2P41231 377 aa20.52■□□□□ 0.88
TSTA3-215ENST00000532308 MAGEA3P43357 314 aa20.52■□□□□ 0.88
TSTA3-215ENST00000532308 ELP6Q0PNE2 266 aa20.52■□□□□ 0.88
TSTA3-215ENST00000532308 CNTN1Q12860 1018 aa20.52■□□□□ 0.88
TSTA3-215ENST00000532308 CBLBQ13191 982 aa20.52■□□□□ 0.88
TSTA3-215ENST00000532308 ELF2Q15723 593 aa20.52■□□□□ 0.88
TSTA3-215ENST00000532308 BBS9Q3SYG4 887 aa20.52■□□□□ 0.88
TSTA3-215ENST00000532308 FNBP1LQ5T0N5 605 aa20.52■□□□□ 0.88
TSTA3-215ENST00000532308 CERCAMQ5T4B2 595 aa20.52■□□□□ 0.88
TSTA3-215ENST00000532308 ARMC3Q5W041 872 aa20.52■□□□□ 0.88
TSTA3-215ENST00000532308 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
TSTA3-215ENST00000532308 USP30Q70CQ3 517 aa20.52■□□□□ 0.88
TSTA3-215ENST00000532308 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa20.52■□□□□ 0.88
TSTA3-215ENST00000532308 AADATQ8N5Z0 425 aa20.52■□□□□ 0.88
TSTA3-215ENST00000532308 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa20.52■□□□□ 0.88
TSTA3-215ENST00000532308 LRRC39Q96DD0 335 aa20.52■□□□□ 0.88
TSTA3-215ENST00000532308 HHIPQ96QV1 700 aa20.52■□□□□ 0.88
TSTA3-215ENST00000532308 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
TSTA3-215ENST00000532308 LYSMD1Q96S90 227 aa20.52■□□□□ 0.88
TSTA3-215ENST00000532308 TRABDQ9H4I3 376 aa20.52■□□□□ 0.88
TSTA3-215ENST00000532308 C2orf42Q9NWW7 574 aa20.52■□□□□ 0.88
TSTA3-215ENST00000532308 MAGEB16A2A368 324 aa20.51■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 SLC7A4O43246 635 aa20.51■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 ALPIP09923 528 aa20.51■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 ECHS1P30084 290 aa20.51■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 HNF1BP35680 557 aa20.51■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 ABL2P42684 1182 aa20.51■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 VSNL1P62760 191 aa20.51■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 FAM193AP78312 1265 aa20.51■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 PCID2Q5JVF3 399 aa20.51■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 ANO7Q6IWH7 933 aa20.51■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 BRSK1Q8TDC3 778 aa20.51■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 PWWP2AQ96N64 755 aa20.51■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 RANBP9Q96S59 729 aa20.51■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 PCDH12Q9NPG4 1184 aa20.51■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 ITM2CQ9NQX7 267 aa20.51■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 RAB21Q9UL25 225 aa20.51■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 FZD4Q9ULV1 537 aa20.51■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 HEATR9A2RTY3 570 aa20.5■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 E7ESA3 106 aa20.5■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 TNFRSF10AO00220 468 aa20.5■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 PLK4O00444 970 aa20.5■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 CRTAMO95727 393 aa20.5■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 PRKCGP05129 697 aa20.5■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 PIRTP0C851 137 aa20.5■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 ADRA1DP25100 572 aa20.5■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 VIPR1P32241 457 aa20.5■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 PDE1BQ01064 536 aa20.5■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 POU6F1Q14863 301 aa20.5■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa20.5■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 DPPA4Q7L190 304 aa20.5■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa20.5■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 RASSF3Q86WH2 238 aa20.5■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 CCDC25Q86WR0 208 aa20.5■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 SIGLEC10Q96LC7 697 aa20.5■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 SAMD15Q9P1V8 674 aa20.5■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 B4GALT6Q9UBX8 382 aa20.5■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 ZNF711Q9Y462 761 aa20.5■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 MYLKQ15746 1914 aa20.5■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 C2orf81A6NN90 581 aa20.49■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 AP1G1O43747 822 aa20.49■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 ZNF30P17039 623 aa20.49■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 MTM1Q13496 603 aa20.49■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 SEPT6Q14141 434 aa20.49■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 ARHGEF7Q14155 803 aa20.49■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 MSS51Q4VC12 460 aa20.49■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 LRRC73Q5JTD7 316 aa20.49■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 AGBL4Q5VU57 503 aa20.49■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 DENND2CQ68D51 928 aa20.49■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 CASC4Q6P4E1 433 aa20.49■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 CRTC1Q6UUV9 634 aa20.49■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 CCNJLQ8IV13 435 aa20.49■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 FBXL6Q8N531 539 aa20.49■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 MDGA1Q8NFP4 955 aa20.49■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 FAM131CQ96AQ9 280 aa20.49■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 GPR63Q9BZJ6 419 aa20.49■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 SAYSD1Q9NPB0 183 aa20.49■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 SYBUQ9NX95 663 aa20.49■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 SPO11Q9Y5K1 396 aa20.49■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 FADS3Q9Y5Q0 445 aa20.49■□□□□ 0.87
TSTA3-215ENST00000532308 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms