RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515749.1

SEC31A-241, Transcript of SEC31 homolog A, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SEC31A, Length 829 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31A-241ENST00000515749 LMLNQ96KR4 655 aa7.56□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 PLCD4Q9BRC7 762 aa7.56□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 MCMBPQ9BTE3 642 aa7.56□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 BBS2Q9BXC9 721 aa7.56□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 FAM117AQ9C073 453 aa7.56□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 MFSD1Q9H3U5 465 aa7.56□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 RHOJQ9H4E5 214 aa7.56□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 TRPV4Q9HBA0 871 aa7.56□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 LMCD1Q9NZU5 365 aa7.56□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 HS3ST2Q9Y278 367 aa7.56□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa7.56□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 PLLPQ9Y342 182 aa7.56□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 RAI2Q9Y5P3 530 aa7.56□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa7.56□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 MYO9BQ13459 2157 aa7.56□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 HMX2A2RU54 273 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 TTLL8A6PVC2 850 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 EBAG9O00559 213 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 BIRC5O15392 142 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 LDB2O43679 373 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 FZD6O60353 706 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 SNAP91O60641 907 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 GLRA3O75311 464 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 SPAG7O75391 227 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 IGSF6O95976 241 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 GSRP00390 522 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 APOA4P06727 396 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 DHRS4L1P0CG22 281 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 CEBPBP17676 345 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 GLDCP23378 1020 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 TYK2P29597 1187 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 NNMTP40261 264 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 MAGEA12P43365 314 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 GRIA4P48058 902 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 NRIP1P48552 1158 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 SERPINB8P50452 374 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 PRAMEP78395 509 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 SEPT6Q14141 434 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 IHHQ14623 411 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 E2F5Q15329 346 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 PDK4Q16654 411 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 ZSCAN26Q16670 478 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 CCDC153Q494R4 210 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 PITRM1Q5JRX3 1037 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 ARMC12Q5T9G4 340 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 FSTL4Q6MZW2 842 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 MRNIPQ6NTE8 343 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 LVRNQ6Q4G3 990 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 CES3Q6UWW8 571 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 TPGS1Q6ZTW0 290 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 MICALCLQ6ZW33 695 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 GPR149Q86SP6 731 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 TAX1BP1Q86VP1 789 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 TMEM25Q86YD3 366 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 AHI1Q8N157 1196 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 TCP10LQ8TDR4 215 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 LRRC8CQ8TDW0 803 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 OSCP1Q8WVF1 389 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 SMARCD2Q92925 531 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 RMDN1Q96DB5 314 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 TCF12Q99081 682 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 GPR22Q99680 433 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 MAGEE1Q9HCI5 957 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.24e-10■■■□□ 16.5
SEC31A-241ENST00000515749 LHX3Q9UBR4 397 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 SLC25A13Q9UJS0 675 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 MID2Q9UJV3 735 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 FBXO10Q9UK96 956 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 SLC8A2Q9UPR5 921 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 CCL26Q9Y258 94 aa7.55□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.54□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 KLF11O14901 512 aa7.54□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 UGT1A9O60656 530 aa7.54□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 RPP40O75818 363 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 PIAS1O75925 651 aa7.54□□□□□ -1.2
SEC31A-241ENST00000515749 NFATC1O95644 943 aa7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms