RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328839.3

PPP4R4-202, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4R4, Length 876 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4-202ENST00000328839 D6RAR5 112 aa25.19■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 DFFAO00273 331 aa25.19■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 PLD2O14939 933 aa25.19■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 ITGA2BP08514 1039 aa25.19■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 ELFN1P0C7U0 828 aa25.19■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 LY6DQ14210 128 aa25.19■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 KCTD16Q68DU8 428 aa25.19■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 CCDC81Q6ZN84 652 aa25.19■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 CLEC14AQ86T13 490 aa25.19■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 JAMLQ86YT9 394 aa25.19■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 FBXO39Q8N4B4 442 aa25.19■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 WBP1Q96G27 269 aa25.19■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 STRADBQ9C0K7 418 aa25.19■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 PARVAQ9NVD7 372 aa25.19■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 UNC13CQ8NB66 2214 aa25.18■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 BCL2L1Q07817 233 aa25.18■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 CLN3Q13286 438 aa25.18■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 MAMLD1Q13495 774 aa25.18■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 AGERQ15109 404 aa25.18■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 ERMARDQ5T6L9 678 aa25.18■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa25.18■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 RFX8Q6ZV50 586 aa25.18■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 RAB11FIP2Q7L804 512 aa25.18■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 TAF8Q7Z7C8 310 aa25.18■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 OR6C4Q8NGE1 309 aa25.18■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 MOSPD1Q9UJG1 213 aa25.18■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 SCN8AQ9UQD0 1980 aa25.17■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 A0A1W2PQM1 296 aa25.17■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 A8MX80 341 aa25.17■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 K7ENP7 123 aa25.17■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 AGRPO00253 132 aa25.17■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 CSNK1DP48730 415 aa25.17■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 INHBCP55103 352 aa25.17■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 RALGDSQ12967 914 aa25.17■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa25.17■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 OR56A4Q8NGH8 313 aa25.17■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 OR1E3Q8WZA6 343 aa25.17■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 TTC9Q92623 222 aa25.17■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 PEBP4Q96S96 227 aa25.17■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 SEMA4CQ9C0C4 833 aa25.17■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 LRRN3Q9H3W5 708 aa25.17■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 DGKBQ9Y6T7 804 aa25.17■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 TMEM202A6NGA9 273 aa25.16■■□□□ 1.62
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PPP4R4-202ENST00000328839 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 HGFP14210 728 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 ERCC2P18074 760 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 SLC5A2P31639 672 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 UGT1A5P35504 534 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 SCNN1BP51168 640 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 KIAA1024LP59773 190 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 LIPIQ6XZB0 460 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 CLEC17AQ6ZS10 378 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 CCNJLQ8IV13 435 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 FAM46DQ8NEK8 389 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 TMEM74Q96NL1 305 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 FGF22Q9HCT0 170 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 SSUH2Q9Y2M2 353 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 LRRC10BA6NIK2 292 aa25.15■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 B4DGG1 531 aa25.15■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 PRPSAP2O60256 369 aa25.15■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 RNF8O76064 485 aa25.15■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 KELP23276 732 aa25.15■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 ACOX1Q15067 660 aa25.15■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa25.15■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa25.15■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 NPWQ8N729 165 aa25.15■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 PISDQ9UG56 409 aa25.15■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF462Q96JM2 2506 aa25.14■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 COL6A6A6NMZ7 2263 aa25.14■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 CFAP69A5D8W1 941 aa25.14■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 JMJD7P0C870 316 aa25.14■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 ATP1A3P13637 1013 aa25.14■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 IL10RBQ08334 325 aa25.14■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 AFMIDQ63HM1 303 aa25.14■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa25.14■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 DPPA4Q7L190 304 aa25.14■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 AOPEPQ8N6M6 819 aa25.14■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa25.14■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 GPR156Q8NFN8 814 aa25.14■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 ECHDC3Q96DC8 303 aa25.14■■□□□ 1.62
PPP4R4-202ENST00000328839 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
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